More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1353 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 		 692 aa  717    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  73.4 
 
 		 666 aa  1020    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 		 652 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 		 664 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 		 656 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1356    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  50.25 
 
 		 650 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  51.34 
 
 		 651 aa  641    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  48.58 
 
 		 657 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  48.21 
 
 		 631 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 		 656 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  52.06 
 
 		 652 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  49.93 
 
 		 656 aa  666    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  52.44 
 
 		 644 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  50 
 
 		 631 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  61.17 
 
 		 666 aa  865    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  50.54 
 
 		 649 aa  653    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.24 
 
 		 657 aa  643    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  48.93 
 
 		 653 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  51.9 
 
 		 648 aa  662    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  48.89 
 
 		 664 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  49.37 
 
 		 636 aa  645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.99 
 
 		 652 aa  660    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  63.57 
 
 		 668 aa  860    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 		 655 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 		 657 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  49.53 
 
 		 636 aa  641    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.41 
 
 		 670 aa  652    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  52.67 
 
 		 660 aa  646    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50.54 
 
 		 660 aa  658    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  53.7 
 
 		 656 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  49.53 
 
 		 636 aa  645    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 667 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  63.6 
 
 		 670 aa  855    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  49.68 
 
 		 632 aa  661    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  57.93 
 
 		 638 aa  770    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 		 632 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  49.46 
 
 		 650 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  64.13 
 
 		 667 aa  889    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 652 aa  687    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  49.32 
 
 		 660 aa  641    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  65.81 
 
 		 666 aa  899    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  52.63 
 
 		 638 aa  679    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.55 
 
 		 667 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  49.29 
 
 		 666 aa  634  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  49.12 
 
 		 664 aa  634  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  47.26 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.9 
 
 		 643 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  48.98 
 
 		 649 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  51.53 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  46.91 
 
 		 639 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 		 655 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  46.62 
 
 		 661 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  47.47 
 
 		 652 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  52.11 
 
 		 661 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  48.64 
 
 		 667 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  50.57 
 
 		 659 aa  618  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  48.01 
 
 		 661 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  49.52 
 
 		 663 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  47 
 
 		 667 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  48.45 
 
 		 649 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  47.83 
 
 		 658 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  48.03 
 
 		 655 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.29 
 
 		 655 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  48.03 
 
 		 655 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  46.83 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  47.11 
 
 		 661 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  49.14 
 
 		 657 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  47.86 
 
 		 658 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  48.12 
 
 		 659 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  47.86 
 
 		 658 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  48.1 
 
 		 654 aa  611  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  48.81 
 
 		 649 aa  611  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  47.97 
 
 		 658 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  48.62 
 
 		 715 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  49.19 
 
 		 658 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  47.83 
 
 		 655 aa  608  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  48.23 
 
 		 661 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  48.36 
 
 		 652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  48.03 
 
 		 673 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  47.35 
 
 		 660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  45.44 
 
 		 657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  50.16 
 
 		 657 aa  601  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  48.2 
 
 		 660 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  48.13 
 
 		 660 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  45.62 
 
 		 644 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 		 674 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  47.98 
 
 		 660 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  48.78 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  48.29 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  48.35 
 
 		 649 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  45.65 
 
 		 648 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  47.32 
 
 		 629 aa  592  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  47.66 
 
 		 656 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  44.67 
 
 		 652 aa  589  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 		 661 aa  591  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  47.03 
 
 		 657 aa  591  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  47.77 
 
 		 661 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  44.19 
 
 		 652 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  44.19 
 
 		 652 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>