More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0915 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  52.66 
 
 
644 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.46 
 
 
664 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.23 
 
 
657 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  53.54 
 
 
653 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  57.36 
 
 
626 aa  712    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  54.87 
 
 
650 aa  665    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  53.27 
 
 
650 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54.63 
 
 
655 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.07 
 
 
658 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 
664 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
657 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  55.02 
 
 
657 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  72.76 
 
 
635 aa  983    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  57.12 
 
 
648 aa  718    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  52.94 
 
 
650 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.39 
 
 
666 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.82 
 
 
661 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  53.8 
 
 
639 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.65 
 
 
656 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  57.53 
 
 
632 aa  726    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  52.03 
 
 
651 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.5 
 
 
631 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  54.74 
 
 
651 aa  689    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  77.58 
 
 
631 aa  1016    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  70.32 
 
 
629 aa  938    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  67.26 
 
 
625 aa  885    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  68.23 
 
 
629 aa  913    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  53.37 
 
 
639 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.07 
 
 
658 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  69.15 
 
 
629 aa  924    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.19 
 
 
656 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  100 
 
 
631 aa  1300    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  55.01 
 
 
643 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.62 
 
 
652 aa  678    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  55.24 
 
 
636 aa  667    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  53.28 
 
 
649 aa  661    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.65 
 
 
664 aa  638    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  54.52 
 
 
656 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.49 
 
 
655 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  53.5 
 
 
631 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  51.9 
 
 
649 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  74.8 
 
 
632 aa  1023    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  67.74 
 
 
629 aa  914    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  51.42 
 
 
632 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  55.48 
 
 
659 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  54.7 
 
 
670 aa  663    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  55.39 
 
 
660 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  51.98 
 
 
656 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  50.74 
 
 
656 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
667 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 
667 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  71.75 
 
 
632 aa  975    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  51.57 
 
 
632 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  51.89 
 
 
627 aa  660    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  52.75 
 
 
667 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.9 
 
 
667 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  50.23 
 
 
658 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.58 
 
 
660 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  48.42 
 
 
652 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.16 
 
 
661 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  50.31 
 
 
658 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  53 
 
 
660 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
655 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  51.72 
 
 
636 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  54.08 
 
 
661 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  54.39 
 
 
659 aa  620  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  51.58 
 
 
655 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  49.53 
 
 
673 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 
649 aa  617  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  48.66 
 
 
663 aa  616  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  50.48 
 
 
661 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  50.9 
 
 
636 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
663 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  48.83 
 
 
662 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  47.87 
 
 
657 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  49.05 
 
 
649 aa  614  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
655 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.3 
 
 
655 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  50.74 
 
 
636 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  50.75 
 
 
638 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.89 
 
 
667 aa  614  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  47.3 
 
 
652 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  50.82 
 
 
648 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.65 
 
 
660 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  51.75 
 
 
657 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  46.98 
 
 
652 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  47.62 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.64 
 
 
660 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.73 
 
 
660 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53 
 
 
644 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  51.24 
 
 
666 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.23 
 
 
660 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  48.04 
 
 
650 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  50.33 
 
 
645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  50.41 
 
 
645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  49.04 
 
 
644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  48.24 
 
 
638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  49.59 
 
 
651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  49.61 
 
 
654 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  49.28 
 
 
647 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>