More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1852 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 
645 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  54.4 
 
 
670 aa  650    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  51.52 
 
 
666 aa  665    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  52.16 
 
 
652 aa  691    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  55.75 
 
 
654 aa  686    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52.56 
 
 
644 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
662 aa  675    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.06 
 
 
660 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 
648 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  51.47 
 
 
657 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  55.04 
 
 
645 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  51.7 
 
 
645 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  51.97 
 
 
651 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
657 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  60.49 
 
 
656 aa  806    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
664 aa  657    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  50.92 
 
 
654 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  54.53 
 
 
656 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.96 
 
 
658 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  54.75 
 
 
651 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.06 
 
 
655 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 
652 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  59.6 
 
 
657 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 
650 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
657 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  55.52 
 
 
629 aa  682    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 
645 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.27 
 
 
658 aa  723    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  51.94 
 
 
651 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.6 
 
 
667 aa  722    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.88 
 
 
673 aa  722    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  55.1 
 
 
666 aa  742    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.49 
 
 
657 aa  712    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  51.39 
 
 
659 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  55.1 
 
 
661 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  54.2 
 
 
653 aa  703    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 
651 aa  641    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.05 
 
 
660 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  58.54 
 
 
656 aa  781    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 
646 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.52 
 
 
660 aa  704    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  53.24 
 
 
631 aa  698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 
651 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.84 
 
 
652 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  51.47 
 
 
657 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  56.16 
 
 
629 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  51.98 
 
 
625 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  55.09 
 
 
629 aa  681    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  51.71 
 
 
645 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  51.01 
 
 
647 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
654 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  53.87 
 
 
631 aa  705    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  49.55 
 
 
664 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  55.2 
 
 
649 aa  770    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  51.95 
 
 
629 aa  637    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 
650 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  50.69 
 
 
649 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.52 
 
 
660 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
655 aa  638    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  52.16 
 
 
644 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.78 
 
 
652 aa  763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 
655 aa  696    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.79 
 
 
658 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  54.56 
 
 
653 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  53.24 
 
 
632 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  58.65 
 
 
644 aa  752    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  53.05 
 
 
645 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  51.19 
 
 
654 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  60.09 
 
 
655 aa  810    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 
644 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  52.19 
 
 
639 aa  685    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  53.16 
 
 
645 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  55.28 
 
 
715 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  54.21 
 
 
650 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  53.31 
 
 
668 aa  658    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  51.67 
 
 
636 aa  654    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  54.4 
 
 
645 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  54.01 
 
 
673 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  54 
 
 
676 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  51.35 
 
 
636 aa  649    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  51.27 
 
 
652 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  55.72 
 
 
659 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  54.65 
 
 
670 aa  717    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  53.31 
 
 
660 aa  703    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  50.68 
 
 
656 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 
650 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  54.32 
 
 
656 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  55.36 
 
 
644 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
650 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  56.45 
 
 
657 aa  730    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  55.73 
 
 
667 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  55.1 
 
 
661 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  51.79 
 
 
656 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  57.98 
 
 
638 aa  737    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  56.2 
 
 
664 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  51.54 
 
 
652 aa  693    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  52.75 
 
 
667 aa  667    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
666 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>