More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3396 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.54 
 
 
649 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
655 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  50.63 
 
 
666 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  50.58 
 
 
652 aa  656    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  59.03 
 
 
639 aa  813    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  53.15 
 
 
635 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.33 
 
 
662 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  54.23 
 
 
657 aa  695    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  59.19 
 
 
639 aa  813    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  66.09 
 
 
650 aa  889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.13 
 
 
655 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  53.42 
 
 
649 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
658 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  54.01 
 
 
668 aa  665    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.78 
 
 
658 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 
645 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.93 
 
 
654 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.94 
 
 
658 aa  670    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 
645 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  55.02 
 
 
649 aa  696    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  50.24 
 
 
663 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.33 
 
 
657 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  53.35 
 
 
629 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 
657 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  51.5 
 
 
631 aa  653    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  66.61 
 
 
644 aa  884    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  65.31 
 
 
650 aa  884    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  48.01 
 
 
667 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.22 
 
 
673 aa  670    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  49.13 
 
 
666 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.75 
 
 
657 aa  649    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  52.6 
 
 
659 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.28 
 
 
661 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
653 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  64.12 
 
 
653 aa  891    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 
660 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.82 
 
 
656 aa  730    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  56.99 
 
 
655 aa  720    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
631 aa  1300    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
670 aa  669    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 
652 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
663 aa  638    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  51.76 
 
 
629 aa  689    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  49.2 
 
 
625 aa  637    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  52.55 
 
 
629 aa  686    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  53.95 
 
 
632 aa  680    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  54.87 
 
 
664 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  51.2 
 
 
647 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  51.54 
 
 
648 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  98.73 
 
 
632 aa  1284    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  51.95 
 
 
654 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.67 
 
 
649 aa  668    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  51.6 
 
 
629 aa  670    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 
650 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  54.94 
 
 
660 aa  708    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  52.9 
 
 
651 aa  684    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 
652 aa  662    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.72 
 
 
664 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.01 
 
 
652 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.82 
 
 
655 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  51.43 
 
 
631 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  51.44 
 
 
632 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.21 
 
 
644 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
664 aa  664    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  53.17 
 
 
647 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  56.13 
 
 
655 aa  715    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  91.44 
 
 
631 aa  1213    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 
652 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.97 
 
 
645 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 
660 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.08 
 
 
638 aa  654    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  53.24 
 
 
656 aa  698    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.85 
 
 
658 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  98.57 
 
 
632 aa  1283    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
645 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.62 
 
 
660 aa  697    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  52.61 
 
 
659 aa  643    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.51 
 
 
670 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.65 
 
 
660 aa  672    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  49.28 
 
 
657 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  54.44 
 
 
661 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  53.53 
 
 
656 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.45 
 
 
644 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.57 
 
 
667 aa  672    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.87 
 
 
657 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 
667 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.24 
 
 
660 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  54.56 
 
 
664 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  54.79 
 
 
638 aa  714    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.63 
 
 
656 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  55.04 
 
 
643 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  53.65 
 
 
667 aa  695    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  52.21 
 
 
661 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  51.81 
 
 
657 aa  679    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.87 
 
 
658 aa  652    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.58 
 
 
661 aa  686    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  53.49 
 
 
648 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  49.28 
 
 
667 aa  666    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 
666 aa  644    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  53.61 
 
 
666 aa  695    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>