More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3454 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 		 664 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  55 
 
 		 660 aa  716    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  54.2 
 
 		 666 aa  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  55.46 
 
 		 660 aa  709    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  59.37 
 
 		 652 aa  813    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  52.54 
 
 		 636 aa  724    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  60.57 
 
 		 652 aa  828    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  50.16 
 
 		 662 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 		 715 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  50.74 
 
 		 631 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  53.7 
 
 		 664 aa  711    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  52.15 
 
 		 661 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  57.19 
 
 		 668 aa  726    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  53.54 
 
 		 650 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  54.33 
 
 		 666 aa  712    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.21 
 
 		 658 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  51.15 
 
 		 632 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 		 656 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.04 
 
 		 658 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.54 
 
 		 667 aa  713    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 664 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  51.65 
 
 		 632 aa  644    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.92 
 
 		 657 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 		 657 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  51.61 
 
 		 661 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  52.01 
 
 		 654 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.92 
 
 		 658 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 		 667 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  52.11 
 
 		 673 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 		 666 aa  712    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.17 
 
 		 657 aa  653    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  52 
 
 		 667 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 		 661 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  53.06 
 
 		 653 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  60.09 
 
 		 652 aa  822    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  52.57 
 
 		 649 aa  693    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 		 656 aa  714    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  52.15 
 
 		 661 aa  646    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  53.53 
 
 		 631 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  51.64 
 
 		 663 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  53.59 
 
 		 667 aa  669    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  51.24 
 
 		 629 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  51.49 
 
 		 625 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  51.07 
 
 		 629 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  57.69 
 
 		 666 aa  750    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  50.72 
 
 		 647 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  55.52 
 
 		 638 aa  740    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  51.54 
 
 		 658 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  48.23 
 
 		 660 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  52.65 
 
 		 632 aa  685    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 		 649 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  52.91 
 
 		 661 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  54.32 
 
 		 656 aa  699    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  53.38 
 
 		 650 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  51.72 
 
 		 644 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  50.41 
 
 		 639 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  50.74 
 
 		 639 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.22 
 
 		 652 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.29 
 
 		 655 aa  681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  54.91 
 
 		 649 aa  710    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.4 
 
 		 660 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.01 
 
 		 644 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 		 663 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  55.87 
 
 		 657 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54.02 
 
 		 655 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 		 655 aa  707    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  52.38 
 
 		 632 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  54.38 
 
 		 629 aa  667    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  51.26 
 
 		 661 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  53.18 
 
 		 670 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  52.72 
 
 		 632 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  52.45 
 
 		 658 aa  657    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  53.5 
 
 		 664 aa  721    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 		 655 aa  673    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  52.88 
 
 		 676 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  54.53 
 
 		 659 aa  661    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  53.88 
 
 		 670 aa  670    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  52.72 
 
 		 660 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  51.44 
 
 		 656 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  49.05 
 
 		 650 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 656 aa  1342    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  49.2 
 
 		 644 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  52.38 
 
 		 636 aa  723    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.83 
 
 		 657 aa  687    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  54.07 
 
 		 667 aa  727    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  52.54 
 
 		 636 aa  722    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.4 
 
 		 666 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  58.91 
 
 		 638 aa  781    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  49.13 
 
 		 663 aa  643    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  50.32 
 
 		 657 aa  644    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  58.64 
 
 		 667 aa  756    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.4 
 
 		 660 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.38 
 
 		 656 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.08 
 
 		 655 aa  673    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.85 
 
 		 649 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.98 
 
 		 661 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  56.85 
 
 		 670 aa  728    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  55.09 
 
 		 643 aa  715    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  53.28 
 
 		 631 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  51.7 
 
 		 654 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>