More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3789 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  52.09 
 
 
631 aa  657    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  52.64 
 
 
635 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  54.41 
 
 
666 aa  689    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
652 aa  658    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  74.13 
 
 
650 aa  989    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  53.75 
 
 
656 aa  704    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 
662 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  60.95 
 
 
639 aa  813    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  56.03 
 
 
664 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  67.51 
 
 
653 aa  925    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  66.14 
 
 
632 aa  891    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  65.82 
 
 
631 aa  889    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  53.9 
 
 
649 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.16 
 
 
658 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  55.23 
 
 
670 aa  671    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  55.45 
 
 
663 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.12 
 
 
658 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.96 
 
 
658 aa  690    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  52.48 
 
 
666 aa  692    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  54.32 
 
 
645 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.85 
 
 
657 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
657 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  53.3 
 
 
651 aa  648    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  54.81 
 
 
661 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  54.59 
 
 
655 aa  701    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.97 
 
 
667 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.85 
 
 
673 aa  689    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  54.13 
 
 
666 aa  718    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.33 
 
 
657 aa  684    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  50.54 
 
 
659 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.15 
 
 
661 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  55.87 
 
 
664 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  53.97 
 
 
657 aa  716    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 
660 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  57.37 
 
 
656 aa  715    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  56.01 
 
 
657 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  66.61 
 
 
631 aa  895    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.82 
 
 
660 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  54.31 
 
 
667 aa  703    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  52.48 
 
 
629 aa  684    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  50.24 
 
 
625 aa  639    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  53.57 
 
 
629 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  53.33 
 
 
632 aa  674    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 
655 aa  701    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  66.3 
 
 
632 aa  892    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  54.1 
 
 
666 aa  676    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  52.57 
 
 
652 aa  677    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  52.54 
 
 
652 aa  665    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.47 
 
 
649 aa  663    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  51.23 
 
 
629 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  53.82 
 
 
661 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  53.16 
 
 
632 aa  655    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  57.31 
 
 
651 aa  697    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 
658 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  54.31 
 
 
668 aa  666    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.98 
 
 
652 aa  718    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  56.42 
 
 
649 aa  707    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  56.03 
 
 
655 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  52.44 
 
 
657 aa  661    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  52.66 
 
 
631 aa  659    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.94 
 
 
644 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  72.76 
 
 
650 aa  990    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  56.57 
 
 
655 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  56.66 
 
 
655 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  52.1 
 
 
638 aa  639    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  57.09 
 
 
643 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  60.62 
 
 
639 aa  815    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  53.63 
 
 
632 aa  682    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  100 
 
 
644 aa  1333    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  54.16 
 
 
645 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.81 
 
 
660 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  52.44 
 
 
664 aa  669    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  51.46 
 
 
659 aa  667    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  53.86 
 
 
670 aa  696    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  53.95 
 
 
660 aa  694    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 
656 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  57.63 
 
 
648 aa  722    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.72 
 
 
656 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.1 
 
 
644 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  54.01 
 
 
649 aa  692    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.45 
 
 
657 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.43 
 
 
667 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  53.42 
 
 
629 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  51.98 
 
 
663 aa  649    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  55.92 
 
 
638 aa  716    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 
648 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  54.08 
 
 
667 aa  680    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  54.56 
 
 
667 aa  700    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  55.93 
 
 
664 aa  722    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.06 
 
 
654 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  52.86 
 
 
660 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 
645 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.63 
 
 
661 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  52.98 
 
 
648 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  56.09 
 
 
656 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  52.48 
 
 
647 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  52.05 
 
 
652 aa  662    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  55.52 
 
 
660 aa  691    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.5 
 
 
660 aa  663    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  50.78 
 
 
650 aa  632  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>