More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4809 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  49.02 
 
 
652 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  49.02 
 
 
652 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  55.56 
 
 
673 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
664 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
644 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
662 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 
660 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  49.02 
 
 
652 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  99.7 
 
 
666 aa  1352    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 
651 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  75.96 
 
 
651 aa  1033    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
680 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  49.02 
 
 
652 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  49.02 
 
 
652 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.6 
 
 
658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
654 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  70.06 
 
 
656 aa  941    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.6 
 
 
658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 
660 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.09 
 
 
655 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 
660 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.69 
 
 
657 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 
661 aa  864    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 
657 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  52.54 
 
 
664 aa  692    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 
645 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.23 
 
 
660 aa  688    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
660 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 
667 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.92 
 
 
673 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
666 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.47 
 
 
657 aa  708    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.73 
 
 
661 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 
653 aa  692    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  55.75 
 
 
660 aa  711    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.85 
 
 
660 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.56 
 
 
656 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
660 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 
651 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.42 
 
 
649 aa  688    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  55.61 
 
 
667 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.69 
 
 
652 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.29 
 
 
657 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.84 
 
 
660 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  50.91 
 
 
658 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  53.69 
 
 
660 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  52.4 
 
 
654 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
660 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  50.78 
 
 
644 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  50.76 
 
 
660 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  81.96 
 
 
653 aa  1109    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  52.17 
 
 
649 aa  696    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 
650 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  50.61 
 
 
649 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 
660 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  51.07 
 
 
657 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 
660 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.83 
 
 
652 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.12 
 
 
655 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 
664 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.69 
 
 
660 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
660 aa  1355    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  57.83 
 
 
644 aa  726    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  49.02 
 
 
652 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 
654 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.39 
 
 
655 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  66.93 
 
 
715 aa  879    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  51.01 
 
 
644 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
645 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 
660 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
663 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 
660 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
664 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  51.84 
 
 
660 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 
645 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  54.95 
 
 
670 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  64.27 
 
 
673 aa  799    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  63.72 
 
 
676 aa  817    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.69 
 
 
660 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 
664 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  56.19 
 
 
658 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  50.23 
 
 
670 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
644 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 
658 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.61 
 
 
650 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  50.4 
 
 
656 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.48 
 
 
644 aa  651    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  64.9 
 
 
654 aa  839    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  64.07 
 
 
657 aa  851    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
667 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 
664 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 
664 aa  881    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  50.92 
 
 
650 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0209  acetyl-CoA synthetase  52.56 
 
 
650 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
660 aa  1355    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 
667 aa  669    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  83.13 
 
 
663 aa  1112    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.7 
 
 
656 aa  701    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.97 
 
 
661 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  58.91 
 
 
656 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>