More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5331 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  53 
 
 
661 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
664 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 
652 aa  651    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  65.31 
 
 
653 aa  836    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  66.2 
 
 
680 aa  884    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  53.02 
 
 
656 aa  690    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  66.45 
 
 
654 aa  861    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  55.18 
 
 
673 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  68.99 
 
 
674 aa  906    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  64.21 
 
 
666 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.05 
 
 
660 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  66.97 
 
 
655 aa  878    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.83 
 
 
656 aa  710    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 
655 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  62.5 
 
 
650 aa  798    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 
663 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  68.05 
 
 
656 aa  928    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  51.69 
 
 
658 aa  691    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  51.89 
 
 
652 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 
655 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  51.32 
 
 
647 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.05 
 
 
657 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  71.6 
 
 
655 aa  989    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 
657 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  67.29 
 
 
662 aa  840    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  51.55 
 
 
655 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  62.64 
 
 
660 aa  821    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 
667 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.56 
 
 
673 aa  711    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.68 
 
 
666 aa  685    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.91 
 
 
657 aa  704    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  52.09 
 
 
654 aa  646    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  51 
 
 
661 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 
653 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1381  acetate/CoA ligase  56.59 
 
 
677 aa  753    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  51.83 
 
 
660 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.81 
 
 
656 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  51.08 
 
 
657 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  54.39 
 
 
665 aa  703    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  51.47 
 
 
664 aa  693    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  54.17 
 
 
667 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 
667 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  64.61 
 
 
658 aa  865    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  53.17 
 
 
652 aa  663    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  55.9 
 
 
649 aa  737    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.42 
 
 
658 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  76.38 
 
 
653 aa  993    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  51.62 
 
 
650 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19340  acetyl-coenzyme A synthetase  53.97 
 
 
741 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.101237  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  67.62 
 
 
715 aa  946    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  68.56 
 
 
661 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 
652 aa  648    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.94 
 
 
649 aa  713    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  56.01 
 
 
660 aa  738    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  58.36 
 
 
658 aa  753    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  57.44 
 
 
656 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  67.07 
 
 
663 aa  912    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  52.11 
 
 
638 aa  676    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  70.4 
 
 
663 aa  917    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.73 
 
 
652 aa  732    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.63 
 
 
655 aa  709    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.92 
 
 
660 aa  686    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  52.12 
 
 
664 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.75 
 
 
655 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  64.21 
 
 
660 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.27 
 
 
644 aa  719    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  51.53 
 
 
658 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  72.74 
 
 
649 aa  962    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.06 
 
 
655 aa  718    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.75 
 
 
658 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  68.33 
 
 
661 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  57.75 
 
 
643 aa  758    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.23 
 
 
660 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  55.21 
 
 
648 aa  711    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  75.08 
 
 
661 aa  997    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.61 
 
 
657 aa  691    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  53.19 
 
 
649 aa  693    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.69 
 
 
667 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  53.68 
 
 
670 aa  656    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  65.34 
 
 
673 aa  821    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  65.86 
 
 
676 aa  862    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  69.62 
 
 
670 aa  924    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 
657 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  51.62 
 
 
659 aa  641    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.98 
 
 
670 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.69 
 
 
660 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  54.52 
 
 
649 aa  722    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  64.78 
 
 
646 aa  838    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.15 
 
 
656 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  63.42 
 
 
651 aa  830    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  61.93 
 
 
651 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  68.69 
 
 
657 aa  927    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.93 
 
 
667 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  67.98 
 
 
667 aa  895    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  69.83 
 
 
664 aa  899    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  68.04 
 
 
665 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  71.12 
 
 
651 aa  913    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  64.21 
 
 
660 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  54.3 
 
 
652 aa  726    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  64.01 
 
 
663 aa  829    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>