More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  56.72 
 
 
651 aa  713    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  54.6 
 
 
646 aa  678    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50.45 
 
 
660 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  53.97 
 
 
656 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  54.76 
 
 
648 aa  709    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  57.27 
 
 
656 aa  773    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  62.61 
 
 
656 aa  789    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  55.03 
 
 
655 aa  729    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  48.74 
 
 
649 aa  635    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  51.49 
 
 
658 aa  650    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  57.43 
 
 
662 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19340  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
741 aa  1485    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.101237  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  54.64 
 
 
715 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  57.08 
 
 
661 aa  715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  55.8 
 
 
663 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  55.34 
 
 
661 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  55 
 
 
654 aa  690    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1381  acetate/CoA ligase  76.74 
 
 
677 aa  1028    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  56.49 
 
 
666 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  52.01 
 
 
650 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  57.63 
 
 
659 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  52.5 
 
 
658 aa  685    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  55.44 
 
 
653 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  56.49 
 
 
660 aa  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  54.84 
 
 
653 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  54.41 
 
 
680 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  48.58 
 
 
643 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  57.74 
 
 
665 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  55.28 
 
 
667 aa  694    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  57.88 
 
 
651 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  65.3 
 
 
670 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  51.33 
 
 
673 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  56.46 
 
 
676 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02430  acetyl-coenzyme A synthetase  61.26 
 
 
734 aa  761    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  55.67 
 
 
655 aa  739    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  58.2 
 
 
663 aa  773    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  55.52 
 
 
649 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  54.61 
 
 
657 aa  718    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  53.16 
 
 
670 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  55.25 
 
 
664 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  58.95 
 
 
661 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  52.31 
 
 
651 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  56.49 
 
 
660 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  55.59 
 
 
663 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  56.58 
 
 
674 aa  725    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  48.68 
 
 
660 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  45.68 
 
 
649 aa  622  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  46.92 
 
 
649 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  48.01 
 
 
656 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  46.07 
 
 
653 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  47.03 
 
 
649 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  46.38 
 
 
655 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  48.08 
 
 
673 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  46.67 
 
 
652 aa  606  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  46.66 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  49.32 
 
 
644 aa  608  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  47.86 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  47.86 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  47.34 
 
 
656 aa  605  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  43.87 
 
 
660 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  46.9 
 
 
657 aa  598  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  47.56 
 
 
655 aa  599  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  46.51 
 
 
648 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  45.95 
 
 
658 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  47.73 
 
 
658 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  47.92 
 
 
654 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  48 
 
 
650 aa  597  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  46.28 
 
 
664 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  48.89 
 
 
655 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  44.41 
 
 
660 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  43.83 
 
 
664 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  46.66 
 
 
664 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  45.99 
 
 
655 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  44.18 
 
 
660 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  43.82 
 
 
660 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  44.77 
 
 
663 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  44.05 
 
 
667 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  46.96 
 
 
657 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  42.34 
 
 
666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  47.42 
 
 
657 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  46.61 
 
 
654 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  48 
 
 
652 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  46.51 
 
 
651 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  47.07 
 
 
660 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  46.79 
 
 
654 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  46.33 
 
 
660 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  45.86 
 
 
657 aa  579  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  47.07 
 
 
660 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  43.41 
 
 
657 aa  582  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  45.23 
 
 
658 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  46.05 
 
 
660 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  45.19 
 
 
656 aa  578  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  45.07 
 
 
658 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  43.47 
 
 
667 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  44.92 
 
 
657 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  46.53 
 
 
652 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  44.74 
 
 
657 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  42.81 
 
 
667 aa  572  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  46.62 
 
 
661 aa  570  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  46.39 
 
 
700 aa  569  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>