More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0211 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  50.76 
 
 
652 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  50.76 
 
 
652 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  50.85 
 
 
652 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  57.36 
 
 
656 aa  740    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.71 
 
 
644 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.36 
 
 
662 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
660 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  51.86 
 
 
648 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  51.88 
 
 
652 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  53.07 
 
 
651 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  66.2 
 
 
654 aa  846    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.89 
 
 
656 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  54.04 
 
 
654 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  70.25 
 
 
656 aa  935    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.71 
 
 
658 aa  718    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 
660 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  54.82 
 
 
655 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  53.15 
 
 
632 aa  653    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.79 
 
 
657 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 
657 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.88 
 
 
660 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 
645 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  53.27 
 
 
660 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  54.25 
 
 
667 aa  708    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.83 
 
 
673 aa  723    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  54.14 
 
 
666 aa  726    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.67 
 
 
657 aa  715    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  52.26 
 
 
650 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.47 
 
 
661 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.18 
 
 
653 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  54.41 
 
 
660 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.34 
 
 
656 aa  734    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.01 
 
 
646 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  53.12 
 
 
660 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  54.12 
 
 
645 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  53.26 
 
 
667 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 
652 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  51.57 
 
 
649 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.88 
 
 
645 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  52.42 
 
 
639 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  52.31 
 
 
644 aa  641    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 
645 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  73.42 
 
 
715 aa  1005    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
654 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.4 
 
 
658 aa  713    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 
660 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  54.97 
 
 
649 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  66.3 
 
 
653 aa  827    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 
650 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  52.08 
 
 
649 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  52.44 
 
 
657 aa  648    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  51.63 
 
 
650 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 
660 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.96 
 
 
652 aa  759    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  57.39 
 
 
655 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 
664 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  52.97 
 
 
660 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  64.85 
 
 
660 aa  849    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  58.87 
 
 
644 aa  756    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  65.53 
 
 
666 aa  850    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 
654 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  56.09 
 
 
655 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  64.15 
 
 
651 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 
651 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 
645 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  54.03 
 
 
660 aa  713    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 
660 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  52.11 
 
 
664 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 
651 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 
645 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  54.5 
 
 
670 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  68.45 
 
 
673 aa  843    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  67.98 
 
 
676 aa  869    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  52.97 
 
 
660 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 
664 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  52.93 
 
 
659 aa  664    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  54.86 
 
 
670 aa  702    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  53.93 
 
 
660 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  51.31 
 
 
656 aa  646    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 
650 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.03 
 
 
656 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.09 
 
 
644 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  54.56 
 
 
631 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  71.6 
 
 
657 aa  957    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
667 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.49 
 
 
645 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  56.15 
 
 
629 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  69.08 
 
 
664 aa  898    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  51.87 
 
 
644 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.17 
 
 
658 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  64.85 
 
 
660 aa  849    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  54.64 
 
 
661 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  65.99 
 
 
663 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>