More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5425 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  59.25 
 
 
660 aa  754    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  65.84 
 
 
674 aa  847    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  64.55 
 
 
658 aa  847    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54.3 
 
 
655 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  52.6 
 
 
654 aa  653    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  52.21 
 
 
661 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 
664 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  66.72 
 
 
667 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  52.29 
 
 
652 aa  682    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  53.54 
 
 
655 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  56.52 
 
 
649 aa  716    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51.39 
 
 
667 aa  656    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  64.01 
 
 
656 aa  830    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  64.42 
 
 
670 aa  837    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  53.57 
 
 
665 aa  685    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  71.14 
 
 
656 aa  949    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.97 
 
 
658 aa  686    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  52.7 
 
 
656 aa  658    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  51.44 
 
 
655 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  65.04 
 
 
661 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.48 
 
 
657 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  66.16 
 
 
715 aa  865    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.03 
 
 
657 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  64.95 
 
 
654 aa  835    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  74.12 
 
 
651 aa  999    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.38 
 
 
660 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  51.97 
 
 
657 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.08 
 
 
667 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.41 
 
 
673 aa  687    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.7 
 
 
666 aa  660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.34 
 
 
657 aa  668    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.66 
 
 
661 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 
653 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  65.57 
 
 
649 aa  864    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.08 
 
 
660 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.17 
 
 
656 aa  697    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  55.27 
 
 
648 aa  676    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  81.78 
 
 
666 aa  1123    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  55.68 
 
 
667 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  56.83 
 
 
658 aa  711    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  69.67 
 
 
661 aa  928    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  53.53 
 
 
652 aa  667    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.03 
 
 
658 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  53.68 
 
 
664 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
654 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 
664 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  68.34 
 
 
651 aa  851    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  60.46 
 
 
650 aa  801    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.39 
 
 
657 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.38 
 
 
649 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  65.99 
 
 
653 aa  814    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  64.12 
 
 
680 aa  850    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  87.14 
 
 
653 aa  1194    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  59.94 
 
 
656 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.3 
 
 
652 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.04 
 
 
655 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  54.32 
 
 
657 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.77 
 
 
660 aa  670    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  72.81 
 
 
648 aa  946    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  69.63 
 
 
655 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  82 
 
 
660 aa  1122    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.44 
 
 
644 aa  699    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  65.75 
 
 
665 aa  813    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.97 
 
 
658 aa  686    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.23 
 
 
655 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  65.2 
 
 
662 aa  843    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1381  acetate/CoA ligase  55.38 
 
 
677 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  62.13 
 
 
646 aa  829    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  65.37 
 
 
655 aa  848    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.1 
 
 
656 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19340  acetyl-coenzyme A synthetase  55.29 
 
 
741 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.101237  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  54.91 
 
 
673 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  68.89 
 
 
663 aa  926    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  54.26 
 
 
670 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  63.36 
 
 
673 aa  783    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  63.36 
 
 
676 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02430  acetyl-coenzyme A synthetase  51.76 
 
 
734 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  54.1 
 
 
649 aa  680    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  53.7 
 
 
650 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  54.49 
 
 
649 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  66.72 
 
 
659 aa  808    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  53.54 
 
 
655 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.5 
 
 
658 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  63.98 
 
 
657 aa  842    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
667 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  64.57 
 
 
661 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  65.53 
 
 
664 aa  844    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  67.55 
 
 
663 aa  855    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.81 
 
 
660 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  82 
 
 
660 aa  1122    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  54.62 
 
 
651 aa  641    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
663 aa  1363    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.82 
 
 
643 aa  684    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  51.83 
 
 
661 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.23 
 
 
660 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  74.54 
 
 
651 aa  1002    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 
663 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.72 
 
 
660 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  50.61 
 
 
660 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  49.84 
 
 
638 aa  632  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>