More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  53.25 
 
 
652 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  53.25 
 
 
652 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  53.25 
 
 
652 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.78 
 
 
644 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.76 
 
 
662 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 
660 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  53.01 
 
 
645 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 
680 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  52.47 
 
 
651 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  65.58 
 
 
715 aa  866    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  53.48 
 
 
660 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  51.54 
 
 
652 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  51.97 
 
 
654 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  65.52 
 
 
656 aa  882    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.31 
 
 
658 aa  719    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 
660 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  55.8 
 
 
655 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  51.54 
 
 
652 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.53 
 
 
657 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.91 
 
 
657 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  50.92 
 
 
657 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 
645 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  54.4 
 
 
660 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.3 
 
 
667 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.77 
 
 
673 aa  720    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 
666 aa  676    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  57.08 
 
 
657 aa  711    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.24 
 
 
661 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  55.42 
 
 
653 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.31 
 
 
660 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.46 
 
 
656 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.85 
 
 
645 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 
660 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.34 
 
 
631 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  58.1 
 
 
667 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  56.7 
 
 
660 aa  716    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  52.47 
 
 
651 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  66.2 
 
 
661 aa  863    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52 
 
 
660 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 
654 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  51.69 
 
 
652 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  53.58 
 
 
658 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  53.76 
 
 
660 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
644 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  52.34 
 
 
649 aa  674    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  50.41 
 
 
638 aa  638    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  54.1 
 
 
649 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  62.69 
 
 
651 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.23 
 
 
660 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 
660 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.9 
 
 
652 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.92 
 
 
655 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.69 
 
 
660 aa  681    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  53.45 
 
 
664 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 
660 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  62.61 
 
 
660 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  58.2 
 
 
644 aa  730    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  53.88 
 
 
652 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  67.3 
 
 
654 aa  871    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.93 
 
 
655 aa  712    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  52.63 
 
 
645 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.92 
 
 
658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.78 
 
 
645 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  53.61 
 
 
645 aa  648    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
660 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  53.76 
 
 
660 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  53.76 
 
 
664 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 
652 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.97 
 
 
645 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  62.61 
 
 
666 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  66.97 
 
 
673 aa  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  66.87 
 
 
676 aa  868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 
660 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  53.45 
 
 
664 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  57.38 
 
 
658 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  49.46 
 
 
670 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  55.56 
 
 
656 aa  706    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  58.47 
 
 
673 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54 
 
 
658 aa  713    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
651 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  51.92 
 
 
653 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  53.25 
 
 
652 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  63.89 
 
 
657 aa  836    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 
667 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 
664 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.23 
 
 
656 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
638 aa  640    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  66.51 
 
 
664 aa  833    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
644 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  53.65 
 
 
633 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  62.61 
 
 
660 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  62.75 
 
 
653 aa  834    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  60.77 
 
 
663 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  53.25 
 
 
652 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>