More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3663 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.12 
 
 		 658 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  48.7 
 
 		 660 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 		 660 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  52.75 
 
 		 655 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  51.69 
 
 		 655 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 660 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  60 
 
 		 654 aa  728    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  53.72 
 
 		 656 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  53.61 
 
 		 633 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  51.69 
 
 		 655 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  54.02 
 
 		 653 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  54.65 
 
 		 646 aa  691    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  54.55 
 
 		 715 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.93 
 
 		 654 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  55.99 
 
 		 656 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.32 
 
 		 658 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  55.57 
 
 		 661 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  55.03 
 
 		 655 aa  686    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.69 
 
 		 649 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.82 
 
 		 657 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.27 
 
 		 657 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  48.78 
 
 		 660 aa  656    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  54.83 
 
 		 661 aa  703    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  55.31 
 
 		 670 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  53.27 
 
 		 660 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 		 667 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  51.97 
 
 		 673 aa  659    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 666 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.5 
 
 		 657 aa  659    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.29 
 
 		 661 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 		 653 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  52.07 
 
 		 667 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  48.55 
 
 		 660 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.98 
 
 		 656 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.82 
 
 		 646 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  52.97 
 
 		 660 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  53.19 
 
 		 664 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 		 667 aa  1348    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 666 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  53.04 
 
 		 660 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  56.02 
 
 		 644 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  56.94 
 
 		 651 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  51.25 
 
 		 645 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 		 657 aa  670    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 		 654 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  51.36 
 
 		 665 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 		 660 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  57.65 
 
 		 667 aa  722    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 		 654 aa  661    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  50.69 
 
 		 649 aa  663    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  54.19 
 
 		 645 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  51.6 
 
 		 657 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  53.5 
 
 		 660 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  50.99 
 
 		 660 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.64 
 
 		 652 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.19 
 
 		 655 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  51.37 
 
 		 658 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 		 664 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 		 660 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 660 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  55.8 
 
 		 644 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 		 663 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.14 
 
 		 655 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.52 
 
 		 657 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 		 664 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  53.03 
 
 		 647 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 667 aa  666    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.82 
 
 		 660 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 		 664 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.41 
 
 		 658 aa  675    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  54.02 
 
 		 645 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  55.93 
 
 		 673 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  56.77 
 
 		 676 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 		 660 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 		 664 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  52.26 
 
 		 634 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 		 664 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  53.1 
 
 		 680 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  53.56 
 
 		 643 aa  694    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  58.73 
 
 		 658 aa  729    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.83 
 
 		 656 aa  675    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  56.57 
 
 		 657 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.45 
 
 		 667 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  54.28 
 
 		 660 aa  688    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  54 
 
 		 664 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  83.8 
 
 		 673 aa  1080    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 660 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  49.08 
 
 		 660 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 		 663 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 660 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.37 
 
 		 661 aa  646    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.57 
 
 		 664 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>