More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3488 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  61.02 
 
 		 663 aa  811    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.02 
 
 		 656 aa  668    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  60.99 
 
 		 651 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 		 650 aa  687    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  53.2 
 
 		 650 aa  672    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  59.47 
 
 		 674 aa  736    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  48.76 
 
 		 660 aa  648    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 		 664 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 		 657 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  58.81 
 
 		 665 aa  707    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  61.23 
 
 		 649 aa  801    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  59.68 
 
 		 653 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  61.1 
 
 		 656 aa  810    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  51 
 
 		 658 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.56 
 
 		 655 aa  661    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19340  acetyl-coenzyme A synthetase  62.19 
 
 		 741 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.101237  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 		 657 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  50.92 
 
 		 657 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  51.94 
 
 		 658 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1381  acetate/CoA ligase  64.95 
 
 		 677 aa  830    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  57.5 
 
 		 670 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.19 
 
 		 673 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.87 
 
 		 657 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  58.47 
 
 		 661 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  58.79 
 
 		 659 aa  721    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 		 653 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  57.23 
 
 		 646 aa  720    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  49.15 
 
 		 660 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.55 
 
 		 656 aa  682    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  59.06 
 
 		 680 aa  756    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  58.81 
 
 		 651 aa  767    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  59.84 
 
 		 666 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  57.44 
 
 		 656 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  51 
 
 		 658 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  47.84 
 
 		 660 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54.23 
 
 		 655 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  54.02 
 
 		 649 aa  676    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 		 655 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  61.56 
 
 		 663 aa  767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.04 
 
 		 649 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  48.84 
 
 		 660 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  57.43 
 
 		 648 aa  730    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  58.55 
 
 		 654 aa  740    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  53.24 
 
 		 665 aa  663    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.72 
 
 		 652 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 		 655 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02430  acetyl-coenzyme A synthetase  62.19 
 
 		 734 aa  740    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  57.66 
 
 		 667 aa  745    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  58.91 
 
 		 660 aa  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.92 
 
 		 644 aa  663    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  61.82 
 
 		 655 aa  804    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 655 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  58.54 
 
 		 653 aa  756    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  52.28 
 
 		 652 aa  667    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 		 664 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  58.1 
 
 		 651 aa  734    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  58.85 
 
 		 655 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  54.62 
 
 		 658 aa  695    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  61.47 
 
 		 661 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  53.62 
 
 		 649 aa  697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 656 aa  1326    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  62.19 
 
 		 670 aa  755    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  55.42 
 
 		 673 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  56.12 
 
 		 676 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.39 
 
 		 655 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  53.45 
 
 		 649 aa  671    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.48 
 
 		 660 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  57.27 
 
 		 715 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  51.79 
 
 		 656 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  52.7 
 
 		 658 aa  669    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  57.45 
 
 		 657 aa  744    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.78 
 
 		 643 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  59.09 
 
 		 664 aa  730    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  53.45 
 
 		 660 aa  697    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  58.51 
 
 		 662 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  58.91 
 
 		 660 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.35 
 
 		 658 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 663 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  58.4 
 
 		 661 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  49.2 
 
 		 666 aa  634  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  53.41 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  50.47 
 
 		 661 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 		 654 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  49.04 
 
 		 657 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 		 654 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  49.69 
 
 		 648 aa  628  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 		 654 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  49.08 
 
 		 660 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  48.3 
 
 		 667 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  50.55 
 
 		 652 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  50.92 
 
 		 650 aa  618  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  51.54 
 
 		 646 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  49.46 
 
 		 658 aa  621  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.97 
 
 		 670 aa  619  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  48.09 
 
 		 667 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  48.49 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  53.62 
 
 		 673 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  50.56 
 
 		 638 aa  621  1e-176  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  49.3 
 
 		 657 aa  618  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>