More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1576 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  54.72 
 
 
651 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
653 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
644 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 
662 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  56.46 
 
 
660 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  53.37 
 
 
648 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  67.54 
 
 
657 aa  930    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
651 aa  660    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  53.24 
 
 
650 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.95 
 
 
656 aa  703    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
651 aa  661    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  56.22 
 
 
665 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  56.77 
 
 
654 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 
656 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
658 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  55.08 
 
 
660 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  56.09 
 
 
655 aa  762    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  51.93 
 
 
651 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.26 
 
 
657 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  56.04 
 
 
657 aa  753    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  53.17 
 
 
653 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 
645 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  53 
 
 
653 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  55.21 
 
 
660 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 
667 aa  656    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.04 
 
 
673 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
666 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.19 
 
 
657 aa  704    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.87 
 
 
661 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  57.45 
 
 
653 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  72.71 
 
 
651 aa  996    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.95 
 
 
660 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.35 
 
 
656 aa  725    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.17 
 
 
646 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  55.32 
 
 
660 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  53.01 
 
 
645 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  53.59 
 
 
652 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  50 
 
 
649 aa  644    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  67.85 
 
 
657 aa  935    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  50.8 
 
 
652 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  52.69 
 
 
645 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  55.38 
 
 
665 aa  726    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  51.24 
 
 
645 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  52.95 
 
 
647 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  55.97 
 
 
654 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  55.81 
 
 
665 aa  741    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  54.74 
 
 
658 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  54.78 
 
 
660 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.25 
 
 
660 aa  701    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  51.47 
 
 
647 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  56.97 
 
 
664 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  53.11 
 
 
650 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  53.35 
 
 
649 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  51.02 
 
 
652 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  55.23 
 
 
660 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.51 
 
 
652 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 
655 aa  660    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  52.39 
 
 
652 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  54.84 
 
 
664 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  54.91 
 
 
660 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  53 
 
 
653 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
644 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
654 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  54.07 
 
 
645 aa  676    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.5 
 
 
655 aa  700    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.55 
 
 
645 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  50.86 
 
 
654 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  54.65 
 
 
645 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.72 
 
 
660 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  52.93 
 
 
651 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  55.06 
 
 
660 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  54.94 
 
 
664 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 
644 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 
645 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  54.81 
 
 
660 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  54.91 
 
 
660 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  54.84 
 
 
664 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  54.21 
 
 
664 aa  718    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  49 
 
 
670 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
650 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  56.04 
 
 
658 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.88 
 
 
644 aa  683    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  67.85 
 
 
657 aa  929    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  51.09 
 
 
657 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
667 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  54.52 
 
 
651 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  54.52 
 
 
651 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
638 aa  660    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  58.54 
 
 
633 aa  733    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.9 
 
 
658 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
715 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
660 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  56.77 
 
 
657 aa  746    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.94 
 
 
661 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>