More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1456 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  73.38 
 
 
652 aa  1025    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
661 aa  1358    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
667 aa  640    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 
638 aa  632  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  49.26 
 
 
666 aa  629  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  51.47 
 
 
666 aa  621  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
668 aa  615  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 
670 aa  598  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  49.29 
 
 
666 aa  596  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  47.06 
 
 
656 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  48.28 
 
 
664 aa  591  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  46.61 
 
 
638 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  45.81 
 
 
636 aa  581  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  45.66 
 
 
636 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  45.89 
 
 
652 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  45.5 
 
 
636 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  45.43 
 
 
652 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  45.62 
 
 
652 aa  571  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  48.5 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  45.31 
 
 
661 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  45.92 
 
 
649 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  43.9 
 
 
656 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  47.83 
 
 
629 aa  552  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  46.09 
 
 
652 aa  549  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  46.08 
 
 
643 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  44.91 
 
 
655 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  44.91 
 
 
655 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  44.8 
 
 
657 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  45.44 
 
 
655 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  45.25 
 
 
639 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  45.14 
 
 
649 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  47.63 
 
 
650 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  44.44 
 
 
648 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  44.07 
 
 
660 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  44.34 
 
 
639 aa  544  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  46.17 
 
 
670 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  44.98 
 
 
633 aa  545  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  45.64 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  43.23 
 
 
664 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  46.41 
 
 
655 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  44.27 
 
 
649 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  47.28 
 
 
632 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  43.51 
 
 
664 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  46.9 
 
 
651 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  43.79 
 
 
667 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  44.09 
 
 
660 aa  538  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  44.87 
 
 
646 aa  538  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  44.12 
 
 
657 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  44.75 
 
 
652 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  42.95 
 
 
661 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  45.59 
 
 
629 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  46.91 
 
 
636 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  43.07 
 
 
655 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  46.53 
 
 
629 aa  528  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  44.41 
 
 
632 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  44.57 
 
 
631 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  44.57 
 
 
632 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  46.92 
 
 
629 aa  527  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  42.9 
 
 
656 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  42.33 
 
 
657 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  43.24 
 
 
658 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  41.1 
 
 
664 aa  525  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  42.99 
 
 
658 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  42.62 
 
 
660 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  45.44 
 
 
680 aa  525  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  44.71 
 
 
656 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  45.62 
 
 
674 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  42.95 
 
 
667 aa  525  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  42.02 
 
 
657 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  44.3 
 
 
631 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  43.64 
 
 
658 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  45.5 
 
 
661 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  44.05 
 
 
653 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  42.31 
 
 
649 aa  519  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  42.01 
 
 
667 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  46 
 
 
644 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  43.55 
 
 
660 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  46.08 
 
 
659 aa  522  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  45.27 
 
 
632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  42.57 
 
 
673 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  43.37 
 
 
651 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  44.01 
 
 
632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  45.72 
 
 
670 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  42.32 
 
 
648 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  45.71 
 
 
644 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  41.74 
 
 
658 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  44.25 
 
 
651 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  42.38 
 
 
660 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  40.49 
 
 
666 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  41.9 
 
 
660 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  45.94 
 
 
662 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  43.18 
 
 
650 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  44.66 
 
 
667 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  42.23 
 
 
660 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  45.29 
 
 
661 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  44.03 
 
 
625 aa  510  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  42.79 
 
 
663 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  43.15 
 
 
656 aa  511  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  44.32 
 
 
654 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  43.44 
 
 
651 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>