More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1300 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 627 aa  1278    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  55.29 
 
 		 650 aa  700    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  54.23 
 
 		 632 aa  679    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  53.82 
 
 		 880 aa  670    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  54.03 
 
 		 651 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  53.12 
 
 		 629 aa  650    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  53.12 
 
 		 632 aa  669    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  52.49 
 
 		 629 aa  648    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  50.95 
 
 		 629 aa  640    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  60.57 
 
 		 636 aa  768    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  53.04 
 
 		 632 aa  681    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  69.8 
 
 		 835 aa  788    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  51.89 
 
 		 631 aa  660    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  52.07 
 
 		 635 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  53.13 
 
 		 631 aa  647    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  53.49 
 
 		 626 aa  684    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  51.36 
 
 		 629 aa  630  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  51.31 
 
 		 650 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  49.36 
 
 		 625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  50.48 
 
 		 639 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  49.61 
 
 		 651 aa  598  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  49.68 
 
 		 650 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  50.16 
 
 		 639 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  47.09 
 
 		 649 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.76 
 
 		 655 aa  593  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  48.35 
 
 		 648 aa  585  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  49.53 
 
 		 657 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  46.7 
 
 		 652 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 		 643 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  47.26 
 
 		 638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  47.29 
 
 		 657 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  45.05 
 
 		 657 aa  572  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  49.33 
 
 		 670 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  46.73 
 
 		 656 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  44.84 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  44.84 
 
 		 667 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  47.36 
 
 		 655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  47.36 
 
 		 664 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  47.04 
 
 		 660 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  47.36 
 
 		 655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  46.68 
 
 		 655 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  48.25 
 
 		 655 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  47.05 
 
 		 664 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  45.47 
 
 		 652 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  46.09 
 
 		 660 aa  558  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  44.83 
 
 		 667 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  45.81 
 
 		 673 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  47.68 
 
 		 656 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  46.77 
 
 		 658 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  44.39 
 
 		 649 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  46.58 
 
 		 655 aa  553  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  43.93 
 
 		 664 aa  555  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  48.24 
 
 		 660 aa  554  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  45.87 
 
 		 658 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  46.11 
 
 		 661 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  46.57 
 
 		 656 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  44.46 
 
 		 667 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  48.43 
 
 		 658 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 		 666 aa  548  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  47.12 
 
 		 667 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  49.1 
 
 		 644 aa  548  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  46.43 
 
 		 632 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  46.38 
 
 		 658 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  45.25 
 
 		 649 aa  545  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  46.86 
 
 		 653 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  47.05 
 
 		 656 aa  548  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  46.97 
 
 		 650 aa  545  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  47.58 
 
 		 656 aa  545  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  47.39 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  46.28 
 
 		 632 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  46.5 
 
 		 656 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  46.68 
 
 		 631 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  45.68 
 
 		 667 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  45.82 
 
 		 663 aa  544  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  47.15 
 
 		 659 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  49.01 
 
 		 658 aa  543  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  45.68 
 
 		 649 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  47.78 
 
 		 659 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  47.92 
 
 		 657 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  45.12 
 
 		 636 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  45.12 
 
 		 636 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  46.27 
 
 		 661 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  46.63 
 
 		 655 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  47.6 
 
 		 661 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  45.12 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  47.3 
 
 		 668 aa  538  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  45.95 
 
 		 631 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  44.3 
 
 		 636 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  45.02 
 
 		 649 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  44.41 
 
 		 660 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  44.56 
 
 		 660 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 		 661 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  45.21 
 
 		 666 aa  531  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  47 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  43.94 
 
 		 715 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  46.25 
 
 		 651 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  47.03 
 
 		 654 aa  527  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  45.84 
 
 		 656 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  43.71 
 
 		 660 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  45.6 
 
 		 656 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>