More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2340 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1114    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  47.01 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  47.01 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  44.61 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 571 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  46.7 
 
 		 598 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  46.32 
 
 		 587 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  46.21 
 
 		 588 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  46.21 
 
 		 588 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  46.78 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  46.21 
 
 		 588 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  47.4 
 
 		 602 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  45.62 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  46.17 
 
 		 585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  44.05 
 
 		 572 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  43.87 
 
 		 572 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  44.08 
 
 		 607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  44.05 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  43.87 
 
 		 572 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  43.99 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  45.3 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  44.22 
 
 		 584 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  43.38 
 
 		 576 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  44.38 
 
 		 588 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  39 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  37.81 
 
 		 658 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  37.19 
 
 		 653 aa  360  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  37.21 
 
 		 650 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  39.04 
 
 		 656 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  37.57 
 
 		 632 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  38.96 
 
 		 629 aa  353  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  37.03 
 
 		 650 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  36.12 
 
 		 632 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  36.12 
 
 		 631 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  35.79 
 
 		 658 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  35.94 
 
 		 632 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  36.06 
 
 		 673 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  37.74 
 
 		 629 aa  350  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  38.82 
 
 		 629 aa  349  7e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 656 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  37.52 
 
 		 629 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  39.29 
 
 		 655 aa  346  6e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  38.21 
 
 		 631 aa  346  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  35.19 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  36.04 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  36.64 
 
 		 635 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  35.37 
 
 		 658 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 655 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  37.21 
 
 		 652 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  37.08 
 
 		 625 aa  342  9e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  35.46 
 
 		 666 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  35.05 
 
 		 631 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  37.81 
 
 		 651 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  35.37 
 
 		 657 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  34.05 
 
 		 652 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 652 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  36.99 
 
 		 631 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 667 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  37.37 
 
 		 648 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  34.99 
 
 		 656 aa  335  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  36.19 
 
 		 670 aa  335  2e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  35.59 
 
 		 670 aa  335  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  37.75 
 
 		 655 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  37.72 
 
 		 632 aa  333  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  37.23 
 
 		 649 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  36.86 
 
 		 664 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 		 664 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  35.69 
 
 		 657 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  33.63 
 
 		 652 aa  332  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  36.99 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  38.57 
 
 		 644 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  37.97 
 
 		 654 aa  331  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  37.08 
 
 		 657 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  34.67 
 
 		 660 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  37.5 
 
 		 680 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  37.1 
 
 		 651 aa  330  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.28 
 
 		 668 aa  329  9e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  36.83 
 
 		 643 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  34.15 
 
 		 660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  37.41 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  37.1 
 
 		 661 aa  326  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 560 aa  326  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  34.33 
 
 		 660 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 667 aa  326  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  35.56 
 
 		 657 aa  326  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  34.32 
 
 		 660 aa  326  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  36.41 
 
 		 715 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  37.21 
 
 		 674 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 		 653 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  35.3 
 
 		 639 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  35.75 
 
 		 661 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>