More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1854 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
567 aa  1141    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  46.39 
 
 
571 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  46.75 
 
 
571 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  45.49 
 
 
572 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  45.31 
 
 
572 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  45.85 
 
 
572 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  45.49 
 
 
572 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  44.42 
 
 
568 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  44.42 
 
 
568 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  42.01 
 
 
588 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  41.93 
 
 
584 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  42.61 
 
 
588 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  42.01 
 
 
588 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  41.12 
 
 
587 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  39.69 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  42.08 
 
 
588 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  42.18 
 
 
585 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 
539 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  40.7 
 
 
607 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  40 
 
 
576 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  39.79 
 
 
592 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  40.39 
 
 
584 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  39.9 
 
 
602 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  38.98 
 
 
588 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 
598 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 
576 aa  352  8e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
560 aa  336  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 
552 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 
553 aa  317  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  36.04 
 
 
632 aa  316  6e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  35.84 
 
 
666 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  36.51 
 
 
629 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  35.37 
 
 
629 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
552 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  36.01 
 
 
667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  35.78 
 
 
625 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  34.43 
 
 
650 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  34.23 
 
 
632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  34.71 
 
 
670 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  35.13 
 
 
660 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  33.69 
 
 
658 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  36.17 
 
 
629 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  33.33 
 
 
658 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  34.64 
 
 
631 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  35.29 
 
 
638 aa  300  3e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  35.13 
 
 
632 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  35.02 
 
 
632 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  35 
 
 
673 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  35.77 
 
 
655 aa  298  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  35.02 
 
 
632 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  35.2 
 
 
639 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  34.89 
 
 
631 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  35.37 
 
 
639 aa  296  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  35.75 
 
 
631 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  35.48 
 
 
661 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  35.32 
 
 
659 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  34.06 
 
 
650 aa  296  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  35.56 
 
 
658 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  34.69 
 
 
651 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  34.46 
 
 
666 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  34.53 
 
 
631 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  34.46 
 
 
660 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  34.46 
 
 
660 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  34.78 
 
 
661 aa  294  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  33.09 
 
 
626 aa  294  3e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  36.55 
 
 
674 aa  294  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  35.33 
 
 
647 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 
656 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  34 
 
 
655 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  33.09 
 
 
666 aa  293  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  35.07 
 
 
880 aa  293  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
555 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  34.59 
 
 
651 aa  292  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  33.75 
 
 
667 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  33.27 
 
 
667 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  34.06 
 
 
656 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  34.41 
 
 
657 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  34.55 
 
 
670 aa  291  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.03 
 
 
638 aa  291  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
555 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  33.68 
 
 
644 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 
555 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  35.29 
 
 
661 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  33.04 
 
 
653 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.43 
 
 
668 aa  291  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  34.17 
 
 
658 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
537 aa  289  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  33.7 
 
 
661 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  33.87 
 
 
657 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  33.39 
 
 
649 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 
655 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  35.6 
 
 
646 aa  288  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  33.51 
 
 
656 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>