More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3600 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  58.06 
 
 		 576 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  60.73 
 
 		 598 aa  718    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  57.47 
 
 		 588 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  62.15 
 
 		 602 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  60.95 
 
 		 592 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  56.01 
 
 		 598 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  60.6 
 
 		 585 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  61.84 
 
 		 588 aa  729    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  59.3 
 
 		 607 aa  695    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 584 aa  1212    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  59.96 
 
 		 588 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  58.22 
 
 		 584 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  64.15 
 
 		 588 aa  773    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  61.86 
 
 		 587 aa  705    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  59.96 
 
 		 588 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  48.24 
 
 		 568 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  48.24 
 
 		 568 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  46.89 
 
 		 571 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  46.61 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  46.88 
 
 		 571 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  45.74 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  47.04 
 
 		 553 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  44.22 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  40.17 
 
 		 629 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  41.46 
 
 		 632 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 567 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  40.35 
 
 		 667 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  39.79 
 
 		 657 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40 
 
 		 667 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  40.18 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  39.58 
 
 		 656 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  39.65 
 
 		 666 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  40.11 
 
 		 644 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  39.49 
 
 		 635 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 		 664 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  38.07 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  38.98 
 
 		 629 aa  379  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  39.4 
 
 		 629 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  39.26 
 
 		 632 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  37.27 
 
 		 650 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  37.81 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  39.23 
 
 		 670 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  37.44 
 
 		 663 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  39.68 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 560 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  37.89 
 
 		 632 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  37.27 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  37.72 
 
 		 632 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  37.54 
 
 		 631 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  38 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  37.09 
 
 		 631 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  37.72 
 
 		 632 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  39.08 
 
 		 659 aa  369  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  38.16 
 
 		 638 aa  365  1e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 627 aa  363  6e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  38.56 
 
 		 655 aa  363  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  38.56 
 
 		 655 aa  363  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  37.92 
 
 		 660 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  37.81 
 
 		 625 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  39.18 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 657 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  39.22 
 
 		 631 aa  359  9e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  37.94 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  37.46 
 
 		 649 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  38.52 
 
 		 657 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  36.64 
 
 		 655 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 655 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  36.48 
 
 		 657 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  38.58 
 
 		 652 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  37.46 
 
 		 650 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  38.74 
 
 		 644 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  38.08 
 
 		 639 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  38.49 
 
 		 648 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  36.64 
 
 		 656 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  36.95 
 
 		 656 aa  353  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  36.14 
 
 		 658 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  36.47 
 
 		 656 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  38.62 
 
 		 663 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  36.6 
 
 		 652 aa  352  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  38.12 
 
 		 650 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  37.37 
 
 		 639 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  35.79 
 
 		 658 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 663 aa  351  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  36.03 
 
 		 652 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  36.9 
 
 		 667 aa  350  6e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  36.43 
 
 		 652 aa  349  7e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  35.53 
 
 		 660 aa  349  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  39.33 
 
 		 645 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  36.66 
 
 		 666 aa  348  1e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>