More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1412 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  74.15 
 
 
588 aa  882    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  59.93 
 
 
588 aa  680    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  66.04 
 
 
576 aa  748    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  64.07 
 
 
598 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  72.96 
 
 
588 aa  869    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  70.78 
 
 
602 aa  820    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  73.48 
 
 
592 aa  874    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  74.15 
 
 
588 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
587 aa  1181    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  63.53 
 
 
588 aa  715    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  64.91 
 
 
607 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  70.94 
 
 
585 aa  821    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  61.86 
 
 
584 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  67.18 
 
 
598 aa  794    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  66.32 
 
 
584 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  46.91 
 
 
568 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  46.91 
 
 
568 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  47.71 
 
 
571 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  47.27 
 
 
571 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  46.84 
 
 
572 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  46.67 
 
 
572 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  46.49 
 
 
572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  47.75 
 
 
553 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  46.32 
 
 
539 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  44.97 
 
 
553 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  43.06 
 
 
670 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  42.86 
 
 
659 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  41.84 
 
 
629 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 
567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  41.15 
 
 
629 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  40.75 
 
 
625 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 
560 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  41.31 
 
 
631 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  41.56 
 
 
632 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  40.18 
 
 
632 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  40.18 
 
 
632 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  40.18 
 
 
631 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  41.74 
 
 
631 aa  399  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  41.86 
 
 
632 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  41.23 
 
 
638 aa  392  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  39.41 
 
 
650 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  41.31 
 
 
652 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  42.7 
 
 
629 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  41.24 
 
 
656 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  40.46 
 
 
657 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  40.25 
 
 
635 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  39.82 
 
 
631 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  40.17 
 
 
660 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40.11 
 
 
667 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  39.36 
 
 
639 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  40.52 
 
 
661 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  43.31 
 
 
651 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  39.13 
 
 
644 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  39.89 
 
 
639 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  40.11 
 
 
653 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.84 
 
 
648 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  39.96 
 
 
626 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  40.14 
 
 
667 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  39.37 
 
 
632 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  39.06 
 
 
650 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  38.62 
 
 
664 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  40.28 
 
 
667 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  39.69 
 
 
655 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  38.69 
 
 
652 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  38.45 
 
 
666 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
652 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  40.38 
 
 
666 aa  378  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  39.58 
 
 
667 aa  379  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  39.33 
 
 
650 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  41.05 
 
 
638 aa  375  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 
552 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  39.52 
 
 
667 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  40.82 
 
 
661 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  40.43 
 
 
650 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  38.91 
 
 
643 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  41.59 
 
 
655 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  38.69 
 
 
652 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  38.16 
 
 
652 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  39.34 
 
 
656 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  39.55 
 
 
651 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  40.28 
 
 
655 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  40.17 
 
 
645 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  38.6 
 
 
656 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  39.65 
 
 
653 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  39.65 
 
 
658 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  37.59 
 
 
658 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  38.9 
 
 
647 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  39.79 
 
 
647 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  38.85 
 
 
629 aa  369  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  39.79 
 
 
636 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 
552 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  38.61 
 
 
661 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>