More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3465 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 598 aa  1211    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  59.75 
 
 		 576 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  63.34 
 
 		 588 aa  732    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  64.16 
 
 		 584 aa  758    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  64.07 
 
 		 588 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  64.89 
 
 		 602 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  64.07 
 
 		 587 aa  738    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  63.39 
 
 		 592 aa  726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  57.93 
 
 		 588 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  60.86 
 
 		 588 aa  697    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  64.88 
 
 		 607 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  62.86 
 
 		 585 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  63.34 
 
 		 588 aa  732    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  60.73 
 
 		 584 aa  718    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  59.63 
 
 		 598 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  47.56 
 
 		 571 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  47.03 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  47.03 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  47.74 
 
 		 571 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  46.96 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  46.26 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  46.26 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  46.09 
 
 		 572 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  47.9 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  45.3 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  44.85 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  40.24 
 
 		 629 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 		 560 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  40.51 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  38.7 
 
 		 625 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  39.86 
 
 		 632 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  39.9 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  40.63 
 
 		 644 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 552 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  39.08 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  40.68 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  39.32 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  39.47 
 
 		 659 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  38.7 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 		 567 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  39.29 
 
 		 629 aa  364  3e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  37.63 
 
 		 632 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  39.9 
 
 		 661 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  40.42 
 
 		 653 aa  362  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  37.56 
 
 		 650 aa  362  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  37.63 
 
 		 632 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  38.04 
 
 		 652 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  37.46 
 
 		 631 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  38.68 
 
 		 650 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  37.77 
 
 		 667 aa  360  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  37.77 
 
 		 657 aa  359  7e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  37.99 
 
 		 631 aa  359  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  37.69 
 
 		 632 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  38.92 
 
 		 656 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  38.88 
 
 		 631 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  37.35 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  39.26 
 
 		 658 aa  353  4e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  39.72 
 
 		 667 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  36.95 
 
 		 664 aa  352  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 638 aa  351  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  38.59 
 
 		 656 aa  350  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  37.35 
 
 		 643 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 667 aa  348  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  38.29 
 
 		 639 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  38.16 
 
 		 666 aa  348  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  38.11 
 
 		 639 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  36.27 
 
 		 666 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  38.79 
 
 		 661 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  36.44 
 
 		 667 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  39.69 
 
 		 644 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  37.14 
 
 		 655 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  37.06 
 
 		 649 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  37.44 
 
 		 657 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 		 667 aa  343  7e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  37.61 
 
 		 655 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  37.61 
 
 		 655 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  37.16 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  35.51 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  37.41 
 
 		 652 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  38.37 
 
 		 645 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  36.66 
 
 		 652 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  36.89 
 
 		 652 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  37.97 
 
 		 661 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  36.65 
 
 		 657 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  39.69 
 
 		 655 aa  339  8e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  37.91 
 
 		 651 aa  339  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  38.97 
 
 		 645 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  37.11 
 
 		 658 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  38.06 
 
 		 657 aa  337  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  37.67 
 
 		 651 aa  336  5.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  37.39 
 
 		 650 aa  336  5.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  38.67 
 
 		 668 aa  336  7e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>