More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2650 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
553 aa  1096    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  60 
 
 
553 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  47.45 
 
 
607 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  44.38 
 
 
584 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  46.68 
 
 
584 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  44.95 
 
 
588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  44.85 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  45.07 
 
 
588 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  44.97 
 
 
587 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  43.62 
 
 
588 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  43.62 
 
 
588 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  44.92 
 
 
588 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  44.23 
 
 
598 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 
592 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  45.89 
 
 
602 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  43.89 
 
 
576 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  43.21 
 
 
585 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  36.86 
 
 
568 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  36.86 
 
 
568 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  36.28 
 
 
571 aa  343  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  35.06 
 
 
571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  36.04 
 
 
572 aa  337  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  336  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
572 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  36.3 
 
 
572 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
539 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  35.88 
 
 
629 aa  312  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  34.29 
 
 
635 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  35.32 
 
 
632 aa  309  9e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  33.74 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 
560 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  34.45 
 
 
625 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  34.71 
 
 
632 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  33.51 
 
 
631 aa  294  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  33.45 
 
 
650 aa  290  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  34.53 
 
 
631 aa  290  7e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  34.16 
 
 
657 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  34.82 
 
 
629 aa  287  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  34.17 
 
 
656 aa  287  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4994  acetate/CoA ligase  31.9 
 
 
629 aa  286  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596864  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  34.47 
 
 
649 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  35.35 
 
 
661 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  34.53 
 
 
655 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  34.05 
 
 
632 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  33.81 
 
 
629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  33.7 
 
 
632 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  31.92 
 
 
670 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3375  acetyl-CoA synthetase  33.04 
 
 
653 aa  283  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  34.72 
 
 
667 aa  282  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  31.67 
 
 
667 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  33.51 
 
 
631 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  32.73 
 
 
650 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  33.75 
 
 
655 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0914  acetyl-CoA synthetase  32.24 
 
 
653 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  33.39 
 
 
649 aa  280  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  32.62 
 
 
648 aa  280  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  34.94 
 
 
661 aa  279  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  33.57 
 
 
663 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 
567 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  32.03 
 
 
657 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  31.81 
 
 
626 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  33.68 
 
 
656 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
650 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  32.04 
 
 
645 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  32.88 
 
 
649 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  33.87 
 
 
654 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  31.58 
 
 
664 aa  276  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  33.22 
 
 
654 aa  276  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.46 
 
 
644 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  33.16 
 
 
652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  33.16 
 
 
652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  33.16 
 
 
652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4528  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855103  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0685  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 
653 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  32.21 
 
 
648 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4670  acetyl-CoA synthetase  33.16 
 
 
652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3260  acetyl-CoA synthetase  32.82 
 
 
653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  34.77 
 
 
655 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  31.56 
 
 
638 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  32.98 
 
 
659 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  34.4 
 
 
659 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  32.12 
 
 
632 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 
645 aa  273  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  33.87 
 
 
651 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  33.94 
 
 
674 aa  272  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 
652 aa  272  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  34.75 
 
 
670 aa  273  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  32.44 
 
 
647 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  33.51 
 
 
651 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42750  acetyl-CoA synthetase  34.51 
 
 
645 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.74253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 
552 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 
652 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  33.45 
 
 
645 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>