More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2705 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  85.22 
 
 		 552 aa  965    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 552 aa  1152    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  45.28 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 		 562 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  43.7 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  43.46 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  44.27 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  44.85 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  43.4 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 557 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  45 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  43.95 
 
 		 547 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  43.52 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  43.79 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  42.54 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 		 557 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  45.92 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  40.81 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  40.58 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  40.62 
 
 		 568 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  40.62 
 
 		 568 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  39.86 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  40.04 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  39.86 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  39.86 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 560 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  38.7 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  38.52 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  38.35 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  39.72 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  38.12 
 
 		 587 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  38.35 
 
 		 584 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  39.29 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 576 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 595 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  38.12 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  38.12 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 539 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 		 538 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  37.77 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  38.36 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  38.22 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  38.36 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  38.36 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  37.52 
 
 		 607 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 		 539 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  39.39 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  38.36 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  37.92 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  38.18 
 
 		 541 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 		 566 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 576 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  37.61 
 
 		 541 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  37.41 
 
 		 592 aa  362  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  37.59 
 
 		 555 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  39.01 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 528 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 539 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 528 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 530 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 555 aa  359  6e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  38.62 
 
 		 528 aa  359  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 		 528 aa  359  8e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  38.81 
 
 		 528 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 602 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 539 aa  356  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  36.67 
 
 		 576 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 539 aa  356  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 530 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>