More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0757 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  85.06 
 
 
552 aa  972    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
552 aa  1149    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  45.94 
 
 
556 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
562 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  44.24 
 
 
557 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
549 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  44.97 
 
 
554 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 
557 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 
547 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 
548 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
555 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  43.07 
 
 
563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  45.47 
 
 
555 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  45.66 
 
 
555 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 
555 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 
555 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  45.08 
 
 
563 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 
555 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  42.44 
 
 
568 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  42.44 
 
 
568 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  42.1 
 
 
572 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  42.17 
 
 
572 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  40.77 
 
 
571 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  40.73 
 
 
571 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  42.28 
 
 
572 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
572 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.53 
 
 
560 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  42.27 
 
 
537 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 
557 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0231902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 
554 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  39.62 
 
 
569 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 
562 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 
573 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
595 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
576 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
544 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
525 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  39.33 
 
 
535 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  42.4 
 
 
525 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
588 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  38.9 
 
 
584 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
588 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 
539 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 
552 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
539 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 
598 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  38.96 
 
 
587 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 
571 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
539 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 
530 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
588 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 
538 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  40.53 
 
 
598 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
566 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  40.44 
 
 
555 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  40.44 
 
 
541 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  40.44 
 
 
541 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  40.44 
 
 
541 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  40.44 
 
 
541 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 
555 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
539 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  40.26 
 
 
541 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 
609 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
535 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  40.26 
 
 
555 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  39.39 
 
 
522 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
576 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  39.28 
 
 
528 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 
539 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 
539 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  39.39 
 
 
528 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  39.2 
 
 
528 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
530 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  39.39 
 
 
528 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  39.39 
 
 
522 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
555 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  39.39 
 
 
528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
585 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
607 aa  363  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  39.2 
 
 
528 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
539 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 
528 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  39.32 
 
 
541 aa  360  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
535 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 
528 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>