More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1946 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
558 aa  1124    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  55.21 
 
 
562 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  44.93 
 
 
539 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  45.99 
 
 
576 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 
539 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  43.58 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 
539 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 
562 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  42.1 
 
 
541 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  41.47 
 
 
555 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  42.1 
 
 
541 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  42.1 
 
 
541 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 
544 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  42.1 
 
 
541 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  42.1 
 
 
541 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 
535 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  41.47 
 
 
555 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  42.28 
 
 
541 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 
553 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  41.85 
 
 
535 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  42.93 
 
 
557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 
543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  38.95 
 
 
551 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  40.54 
 
 
556 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 
595 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  41.34 
 
 
543 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  44.46 
 
 
538 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 
547 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  42.65 
 
 
535 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 
576 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.84 
 
 
539 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 
571 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 
532 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 
513 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 
560 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 
562 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 
562 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
603 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 
552 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
552 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 
526 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 
525 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 
548 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  37.05 
 
 
572 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  36.61 
 
 
572 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  36.69 
 
 
572 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  36.98 
 
 
572 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  36.69 
 
 
572 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  300  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  37.13 
 
 
571 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
541 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  36.32 
 
 
571 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  35.29 
 
 
568 aa  296  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  35.29 
 
 
568 aa  296  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
571 aa  294  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
555 aa  289  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 
555 aa  289  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
566 aa  289  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  34.41 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
551 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
557 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
552 aa  280  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
616 aa  280  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
552 aa  279  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
530 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  34.22 
 
 
589 aa  277  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  33.57 
 
 
563 aa  276  6e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 
609 aa  276  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 
567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
559 aa  273  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 
593 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
530 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
539 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
539 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 
557 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.15 
 
 
528 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
559 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
554 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 
546 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.27 
 
 
528 aa  266  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  32.97 
 
 
528 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  32.9 
 
 
528 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 
528 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 
528 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  35.74 
 
 
549 aa  266  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
542 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 
522 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
588 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>