More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3834 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  71.19 
 
 		 551 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 543 aa  1104    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  65.62 
 
 		 547 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  91.51 
 
 		 543 aa  988    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  58.87 
 
 		 544 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  59.62 
 
 		 538 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  57.93 
 
 		 532 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  52.34 
 
 		 556 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  55.58 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  55.6 
 
 		 562 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 		 562 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  51.76 
 
 		 539 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  51.76 
 
 		 539 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 539 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 539 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  51.2 
 
 		 553 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  51.76 
 
 		 557 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  51.87 
 
 		 576 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  51.94 
 
 		 541 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  51.02 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  50.83 
 
 		 539 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 		 555 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  51.02 
 
 		 541 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  51.2 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  51.48 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  48.34 
 
 		 562 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  48.21 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  47.47 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  46.68 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  40.47 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 		 526 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 		 558 aa  415  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 603 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 562 aa  364  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 552 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 552 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 537 aa  313  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 567 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 522 aa  306  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 571 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 616 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 560 aa  301  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 609 aa  293  6e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 553 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 585 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 552 aa  287  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  37.77 
 
 		 555 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  37.77 
 
 		 555 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 561 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  33.7 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 548 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 557 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  34.87 
 
 		 588 aa  277  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  32.92 
 
 		 592 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 		 569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  34.87 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  34.87 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 554 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  35.63 
 
 		 607 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 562 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  34.25 
 
 		 602 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 557 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  35.12 
 
 		 587 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  33.52 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 568 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 568 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 548 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 551 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 584 aa  270  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 555 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 547 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  32.12 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  31.93 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>