More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4369 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
542 aa  1108    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  46.11 
 
 
528 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  45.99 
 
 
530 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  45.83 
 
 
528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  46.49 
 
 
528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  46.12 
 
 
522 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  45.83 
 
 
528 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  45.83 
 
 
528 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  45.61 
 
 
530 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  46.12 
 
 
528 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  45.83 
 
 
522 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  45.83 
 
 
528 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  45.92 
 
 
528 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 
528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  43.07 
 
 
531 aa  435  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
539 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
539 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  43.89 
 
 
537 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 
548 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 
560 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 
566 aa  360  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 
552 aa  359  7e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
555 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 
551 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
555 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
554 aa  352  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
609 aa  352  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
552 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 
571 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
546 aa  347  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 
552 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  38.31 
 
 
563 aa  342  8e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 
567 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 
616 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 
566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 
568 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
568 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 
557 aa  333  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  36.4 
 
 
586 aa  332  8e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
568 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  38.59 
 
 
549 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
559 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 
552 aa  331  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.43 
 
 
582 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
565 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
565 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 
559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
559 aa  326  6e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  36.72 
 
 
562 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  36.89 
 
 
568 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  36.89 
 
 
568 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  37.2 
 
 
567 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  323  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  323  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
559 aa  323  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  36.17 
 
 
572 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
572 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  37.55 
 
 
572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  37.55 
 
 
572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  37.16 
 
 
572 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 
556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  37.36 
 
 
572 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 
627 aa  320  5e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
528 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  35.79 
 
 
574 aa  317  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
568 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  38.28 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 
559 aa  314  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  37.04 
 
 
563 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
564 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
564 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  35.23 
 
 
571 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
593 aa  310  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 
609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
576 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  35.45 
 
 
571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  35.74 
 
 
567 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  35.74 
 
 
567 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  35.74 
 
 
567 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  35.66 
 
 
559 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
567 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  35.82 
 
 
567 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 
563 aa  303  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 
564 aa  303  8.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  33.8 
 
 
594 aa  302  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  36.48 
 
 
557 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  36.5 
 
 
576 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  34.38 
 
 
567 aa  299  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  35.66 
 
 
581 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>