More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3071 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  61.7 
 
 		 565 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  63.82 
 
 		 565 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  60.6 
 
 		 562 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  61.07 
 
 		 567 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 559 aa  1148    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  70.24 
 
 		 555 aa  784    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  61.1 
 
 		 564 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  61.1 
 
 		 564 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  62.52 
 
 		 581 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  58.87 
 
 		 567 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  60.07 
 
 		 568 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  57.38 
 
 		 609 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  58.59 
 
 		 572 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  63.82 
 
 		 565 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22620  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  66.41 
 
 		 594 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  58.77 
 
 		 568 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  58.87 
 
 		 567 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  59.11 
 
 		 569 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  61.89 
 
 		 565 aa  673    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  62.52 
 
 		 565 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  61.51 
 
 		 567 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  63.08 
 
 		 576 aa  685    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  61.31 
 
 		 567 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  59.43 
 
 		 574 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  60.15 
 
 		 563 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  64.58 
 
 		 566 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  58.72 
 
 		 566 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  59.77 
 
 		 567 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  59.86 
 
 		 567 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  58.7 
 
 		 568 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2842  AMP-dependent synthetase and ligase  62.43 
 
 		 566 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  61.7 
 
 		 565 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  57.83 
 
 		 568 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  58.87 
 
 		 567 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  69.46 
 
 		 560 aa  761    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  58.33 
 
 		 568 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  63 
 
 		 563 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  65.09 
 
 		 580 aa  725    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  58.99 
 
 		 593 aa  673    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  62.18 
 
 		 571 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  59.14 
 
 		 563 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  57.38 
 
 		 568 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  57.84 
 
 		 568 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  57.84 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  57.38 
 
 		 568 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  57.38 
 
 		 568 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  58.11 
 
 		 567 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  58.71 
 
 		 587 aa  614  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  55.86 
 
 		 562 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  59.11 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  57.19 
 
 		 573 aa  601  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  55.95 
 
 		 576 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  54.53 
 
 		 576 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  56.38 
 
 		 573 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  55.33 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0669  AMP-dependent synthetase and ligase  51.28 
 
 		 560 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  54.46 
 
 		 572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  54.89 
 
 		 577 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  53.82 
 
 		 577 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  43.56 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 567 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 		 616 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  43.72 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  41.56 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  42.04 
 
 		 555 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 		 571 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 559 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  39.42 
 
 		 559 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  43.82 
 
 		 564 aa  377  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  42.99 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  38.56 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 		 559 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.24 
 
 		 594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  40.11 
 
 		 557 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  36.48 
 
 		 550 aa  360  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 534 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 593 aa  351  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 546 aa  349  7e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.57 
 
 		 582 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.34 
 
 		 589 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 537 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.42 
 
 		 550 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  35.78 
 
 		 528 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  36.06 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  36.06 
 
 		 528 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  36.06 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 542 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>