More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  100 
 
 		 550 aa  1139    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  47.57 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  47 
 
 		 552 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  45.3 
 
 		 559 aa  512  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  49.16 
 
 		 627 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  45.4 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  44.22 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  45.61 
 
 		 559 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  45.3 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  45.97 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  42.15 
 
 		 593 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  43.27 
 
 		 534 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  39.97 
 
 		 589 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  40 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  42.7 
 
 		 557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  41.02 
 
 		 582 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 		 551 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  40.51 
 
 		 616 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 546 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  40.4 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 567 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  40.33 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  40.07 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  39.15 
 
 		 586 aa  382  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 537 aa  331  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 567 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 565 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 565 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.56 
 
 		 593 aa  310  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 564 aa  310  5e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  37.72 
 
 		 562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  37.26 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 528 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  37.74 
 
 		 576 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  34.84 
 
 		 528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.84 
 
 		 528 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  34.84 
 
 		 528 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  34.84 
 
 		 528 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 568 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  34.84 
 
 		 528 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 568 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 568 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.65 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  35.57 
 
 		 522 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 568 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 576 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 522 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 528 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 566 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 568 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  35.31 
 
 		 567 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  34.81 
 
 		 574 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 568 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  35.69 
 
 		 567 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 576 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  35.69 
 
 		 567 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  35.69 
 
 		 567 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 573 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 548 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  36.26 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  32.7 
 
 		 531 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 573 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 580 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  33.72 
 
 		 563 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 568 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 563 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 565 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 565 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  34.17 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  34.86 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  33.96 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 569 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>