More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1242 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  64.39 
 
 		 559 aa  790    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  63.67 
 
 		 559 aa  776    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  66.31 
 
 		 559 aa  811    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 557 aa  1159    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  64.21 
 
 		 559 aa  786    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  70.54 
 
 		 534 aa  820    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  65.52 
 
 		 554 aa  770    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  64.56 
 
 		 552 aa  775    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  67.27 
 
 		 627 aa  797    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  51.89 
 
 		 559 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  52.89 
 
 		 557 aa  596  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  50.46 
 
 		 550 aa  590  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  52.27 
 
 		 551 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  52.74 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  53.04 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  50.18 
 
 		 582 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  51.11 
 
 		 546 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  47.29 
 
 		 589 aa  546  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 549 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  47.73 
 
 		 616 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  45.96 
 
 		 593 aa  530  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 		 571 aa  527  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  48.44 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  47.08 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  49.35 
 
 		 566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  46.34 
 
 		 609 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  44.42 
 
 		 594 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 		 552 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  45.44 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  46.51 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  45.3 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  41.74 
 
 		 537 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  40.97 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 		 576 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  38.89 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 566 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 530 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 528 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  39.51 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 560 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  39.51 
 
 		 522 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  39.4 
 
 		 528 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  42.26 
 
 		 564 aa  363  5.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 528 aa  362  9e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 		 530 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  41.32 
 
 		 562 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  39.21 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  39.21 
 
 		 528 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  39.21 
 
 		 522 aa  359  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  39.41 
 
 		 576 aa  359  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  39.02 
 
 		 528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 564 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 564 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 556 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  38.64 
 
 		 567 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  39.39 
 
 		 581 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 577 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  38.4 
 
 		 563 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 573 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 572 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  37.71 
 
 		 567 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 573 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.78 
 
 		 587 aa  345  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 565 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 573 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 576 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  38.49 
 
 		 574 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 548 aa  342  9e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 566 aa  339  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  36.73 
 
 		 567 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  36.73 
 
 		 567 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 565 aa  339  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  36.73 
 
 		 567 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 563 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 569 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>