More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4525 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  64.29 
 
 
560 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  57.73 
 
 
568 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2842  AMP-dependent synthetase and ligase  68.32 
 
 
566 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  68.44 
 
 
581 aa  748    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  78.7 
 
 
566 aa  872    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  79.12 
 
 
565 aa  893    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  68.21 
 
 
567 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  68.25 
 
 
567 aa  732    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  57.73 
 
 
568 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  68.16 
 
 
569 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  59.86 
 
 
576 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  57.5 
 
 
565 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  99.65 
 
 
565 aa  1148    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  64.32 
 
 
555 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  60.75 
 
 
559 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  57.9 
 
 
568 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
565 aa  1151    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
565 aa  1151    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  57.5 
 
 
565 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  59.26 
 
 
563 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  59.03 
 
 
580 aa  658    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  57.89 
 
 
567 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22620  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  61.51 
 
 
594 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  58.72 
 
 
562 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  55.9 
 
 
593 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  57.27 
 
 
571 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  56.99 
 
 
564 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  57.66 
 
 
567 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  56.99 
 
 
564 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  56.36 
 
 
568 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  55.5 
 
 
567 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  57.22 
 
 
572 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  55.38 
 
 
609 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  55.42 
 
 
563 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 
568 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  54.79 
 
 
568 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  54.79 
 
 
568 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  55.04 
 
 
568 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  54.79 
 
 
568 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  56.33 
 
 
566 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  55.34 
 
 
574 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  54.91 
 
 
568 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  54.77 
 
 
563 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  54.43 
 
 
567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  54.43 
 
 
567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  57.22 
 
 
556 aa  584  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  54.43 
 
 
567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  54.77 
 
 
567 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  55.16 
 
 
573 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  56.23 
 
 
573 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  56.7 
 
 
573 aa  579  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  53.56 
 
 
576 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  53.04 
 
 
562 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  55.16 
 
 
587 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  54.16 
 
 
572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  54.64 
 
 
577 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  53.55 
 
 
576 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  54.41 
 
 
577 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0669  AMP-dependent synthetase and ligase  49.64 
 
 
560 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 
551 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  43.63 
 
 
557 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 
552 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  42.86 
 
 
563 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 
571 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  40.55 
 
 
586 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 
567 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  43.3 
 
 
566 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
555 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
609 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  42.16 
 
 
549 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 
549 aa  369  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 
616 aa  369  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
554 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
559 aa  360  5e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 
555 aa  359  6e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 
559 aa  359  7e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
627 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  38.3 
 
 
559 aa  353  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
564 aa  351  2e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
559 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
552 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  38.19 
 
 
557 aa  351  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 
559 aa  350  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.04 
 
 
528 aa  346  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 
546 aa  343  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
593 aa  342  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
537 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 
534 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  36.84 
 
 
550 aa  333  4e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.09 
 
 
594 aa  323  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.8 
 
 
582 aa  322  8e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
530 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.51 
 
 
589 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
557 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 
530 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  37.47 
 
 
539 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  37.47 
 
 
539 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  35.91 
 
 
528 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  35.91 
 
 
528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>