More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0551 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  61.37 
 
 		 559 aa  729    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  61.73 
 
 		 559 aa  745    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  58.8 
 
 		 559 aa  702    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  65.59 
 
 		 559 aa  780    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  65.52 
 
 		 557 aa  766    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  61.55 
 
 		 559 aa  738    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  57.89 
 
 		 557 aa  668    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  63.91 
 
 		 534 aa  733    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  77.76 
 
 		 552 aa  912    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 554 aa  1148    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  64.32 
 
 		 627 aa  758    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  55.39 
 
 		 550 aa  631  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  54.61 
 
 		 582 aa  629  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  53.99 
 
 		 551 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  53.37 
 
 		 549 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  53.28 
 
 		 549 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  51.82 
 
 		 557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  53.28 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  52.65 
 
 		 616 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  51.76 
 
 		 571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  51.65 
 
 		 567 aa  571  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  51.1 
 
 		 609 aa  569  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  52.29 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  48.98 
 
 		 589 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  50.46 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 		 552 aa  548  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  47.28 
 
 		 594 aa  544  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  46.37 
 
 		 593 aa  541  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  49.91 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  47.56 
 
 		 563 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  47.57 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  43.98 
 
 		 537 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.43 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 		 566 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  41.36 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  41.36 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 563 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  41.6 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  41.6 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  41.73 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  41.23 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  41.42 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  41.42 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  41.42 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  41.35 
 
 		 528 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  40.7 
 
 		 562 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  41.48 
 
 		 522 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 		 567 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  41.17 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 		 609 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 		 564 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  39.48 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  39.03 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  38.26 
 
 		 567 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  40.49 
 
 		 567 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 		 573 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  40.04 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 564 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  40.04 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  40.04 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  39.48 
 
 		 571 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 564 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 562 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 572 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  40.77 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  38.94 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 573 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  38.82 
 
 		 563 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  38.85 
 
 		 593 aa  362  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 		 560 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 577 aa  359  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 577 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  38.96 
 
 		 581 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 572 aa  353  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 580 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  38.46 
 
 		 531 aa  350  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  38.05 
 
 		 587 aa  350  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 565 aa  350  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 569 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>