More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0723 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  70.32 
 
 
528 aa  795    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  59.16 
 
 
531 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  70.17 
 
 
522 aa  787    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  70.32 
 
 
528 aa  796    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  70.32 
 
 
528 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  69.75 
 
 
528 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  70.32 
 
 
528 aa  797    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  70.36 
 
 
522 aa  786    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
530 aa  1093    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  70.32 
 
 
528 aa  797    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  69.75 
 
 
528 aa  791    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  63.41 
 
 
539 aa  705    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  63.41 
 
 
539 aa  705    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  83.11 
 
 
530 aa  924    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  70.91 
 
 
528 aa  797    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  70.32 
 
 
528 aa  795    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  58.22 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  49.33 
 
 
537 aa  485  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 
542 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 
609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 
554 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 
528 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 
555 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  40.07 
 
 
586 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 
567 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  39.66 
 
 
559 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 
555 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
552 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
566 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 
616 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
559 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
571 aa  375  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 
552 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
559 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
559 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
559 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  38.64 
 
 
557 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 
552 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  39.41 
 
 
563 aa  360  2e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
627 aa  360  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
566 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
552 aa  359  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 
549 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
557 aa  355  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
546 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
568 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
568 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.06 
 
 
594 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
551 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
568 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.92 
 
 
589 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 
557 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
593 aa  343  5e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.92 
 
 
582 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  38.99 
 
 
549 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  37.41 
 
 
550 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 
534 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  40.24 
 
 
571 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 
609 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
576 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  38.39 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
568 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 
568 aa  326  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 
568 aa  326  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 
525 aa  326  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  38.22 
 
 
567 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
563 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 
564 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
564 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
565 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
564 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
565 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
567 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 
555 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
539 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 
576 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
539 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
556 aa  320  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  37.05 
 
 
571 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  38.06 
 
 
576 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 
595 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 
571 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
568 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  37.83 
 
 
572 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 
573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  40.27 
 
 
508 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  37.76 
 
 
535 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  37.27 
 
 
572 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 
539 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 
573 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  37.27 
 
 
572 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
562 aa  310  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  37.08 
 
 
572 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  37.08 
 
 
572 aa  309  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>