More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4371 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 528 aa  1070    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  48.96 
 
 		 571 aa  508  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  45.76 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  47.74 
 
 		 609 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  48.3 
 
 		 566 aa  485  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  46.69 
 
 		 552 aa  485  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  45.01 
 
 		 586 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 		 555 aa  478  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  48.22 
 
 		 551 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  45.56 
 
 		 616 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  48.97 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  45.56 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 537 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  46.77 
 
 		 549 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  44.49 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  47.02 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  43.86 
 
 		 627 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  42.64 
 
 		 559 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 		 552 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  42.26 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 		 559 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  42.42 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  44.02 
 
 		 546 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  40.45 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  41.78 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  40.68 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  41.35 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  45.26 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  40.57 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 		 530 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  40.27 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  38.28 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  43.52 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  45.81 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  45.11 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  45.76 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 		 609 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  45.76 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  45.76 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  43.1 
 
 		 574 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  45.45 
 
 		 568 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  43.99 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  43.99 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  43.99 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  44.7 
 
 		 581 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  43.94 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  40.23 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 		 576 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  40.57 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  40.54 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  40.23 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  40.04 
 
 		 528 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 564 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  40.54 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 564 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  43.18 
 
 		 567 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 569 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 576 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  44.44 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  40.23 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  44.12 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  39.85 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  42.8 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  45.62 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.61 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  43.76 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  38.39 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 		 568 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  43.86 
 
 		 567 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 		 568 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 		 572 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  43.42 
 
 		 576 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 573 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  44.59 
 
 		 560 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  41.92 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 577 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 		 568 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 		 580 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>