More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2172 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  100 
 
 		 531 aa  1107    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  59.54 
 
 		 528 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  58.3 
 
 		 522 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  58.02 
 
 		 528 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  58.02 
 
 		 528 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  57.63 
 
 		 528 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  58.87 
 
 		 530 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  57.44 
 
 		 528 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  59.16 
 
 		 530 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  58.02 
 
 		 528 aa  651    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  58.11 
 
 		 522 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  58.21 
 
 		 528 aa  656    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  57.82 
 
 		 528 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  58.02 
 
 		 528 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  77.21 
 
 		 539 aa  875    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  77.21 
 
 		 539 aa  875    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 542 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  38.29 
 
 		 586 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 555 aa  363  3e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 566 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 616 aa  360  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 559 aa  360  4e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  37.82 
 
 		 563 aa  354  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 559 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 559 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 554 aa  350  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 557 aa  347  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 552 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  38.26 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 593 aa  332  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  34.22 
 
 		 589 aa  330  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  36.5 
 
 		 557 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  37.07 
 
 		 582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  36.52 
 
 		 550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 568 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 627 aa  325  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 568 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 568 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 563 aa  322  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 572 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  34.98 
 
 		 594 aa  322  8e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 572 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 572 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  36.99 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 552 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  37.19 
 
 		 572 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 551 aa  317  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  36.72 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  35.77 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  35.77 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  36.61 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 546 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 534 aa  310  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 568 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 568 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 568 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  36.07 
 
 		 571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  34.65 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 568 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 609 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 568 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  35.17 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  36.61 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 567 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  34.46 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 562 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 568 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  35.38 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 573 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 576 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 572 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>