More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0993 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  81.2 
 
 		 557 aa  921    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  75.55 
 
 		 549 aa  852    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 551 aa  1129    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  65.07 
 
 		 546 aa  740    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  66.67 
 
 		 549 aa  756    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  53.99 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  53.18 
 
 		 552 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  51.36 
 
 		 559 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  50.91 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  51.09 
 
 		 559 aa  594  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  51.36 
 
 		 627 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  53.28 
 
 		 567 aa  591  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  51.09 
 
 		 559 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  52.27 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  51.37 
 
 		 571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  50.82 
 
 		 616 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  51.64 
 
 		 555 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  50.74 
 
 		 586 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 		 559 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  52.77 
 
 		 534 aa  561  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 		 609 aa  553  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  49.09 
 
 		 555 aa  549  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  49.64 
 
 		 566 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 557 aa  531  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  48.68 
 
 		 550 aa  527  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  46.92 
 
 		 552 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  48.91 
 
 		 582 aa  519  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  46.11 
 
 		 589 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  46.63 
 
 		 563 aa  519  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  46.34 
 
 		 593 aa  507  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.85 
 
 		 594 aa  488  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  48.13 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  44.99 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.74 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 537 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  44.83 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  44.89 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  45.62 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  44.47 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 568 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  43.14 
 
 		 574 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  44.09 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  42.73 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 		 576 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  42.41 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  42.41 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  42.41 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  42.54 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  42.57 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  43.07 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  43.07 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  43.07 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  43.86 
 
 		 581 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  41.83 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  43.58 
 
 		 565 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  41.03 
 
 		 567 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  43.68 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  41.21 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 		 573 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  41.65 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  41.1 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  42.62 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  40.36 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 		 580 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 530 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  38.85 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  38.66 
 
 		 528 aa  359  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2842  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 		 566 aa  359  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  38.66 
 
 		 528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  38.66 
 
 		 528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  38.73 
 
 		 528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  38.55 
 
 		 528 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  38.66 
 
 		 528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  38.69 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 		 572 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  38.69 
 
 		 522 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 		 577 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>