More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1701 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  76.74 
 
 
582 aa  910    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  54.3 
 
 
559 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  54.87 
 
 
559 aa  638    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  55.38 
 
 
559 aa  640    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  54.15 
 
 
559 aa  638    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  58.18 
 
 
552 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  57.89 
 
 
554 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
557 aa  1154    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  54.33 
 
 
559 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  53.68 
 
 
627 aa  610  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  53.64 
 
 
534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  52.89 
 
 
557 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 
593 aa  535  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  47.44 
 
 
550 aa  533  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  49.27 
 
 
546 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 
551 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  48.46 
 
 
549 aa  528  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  50.37 
 
 
566 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  48.9 
 
 
555 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 
616 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 
557 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  48.71 
 
 
555 aa  520  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  49.36 
 
 
549 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  47.4 
 
 
571 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  45.28 
 
 
589 aa  509  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  46.72 
 
 
609 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  46.94 
 
 
567 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  46.59 
 
 
552 aa  503  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  44.04 
 
 
594 aa  496  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  46.11 
 
 
586 aa  488  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  46.53 
 
 
563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  42.7 
 
 
550 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  44.05 
 
 
537 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
528 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  42.27 
 
 
528 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  42.47 
 
 
528 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
528 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
528 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  42.07 
 
 
522 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
522 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
528 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  41.29 
 
 
528 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  41.68 
 
 
528 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
528 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 
564 aa  359  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
530 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 
548 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
539 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
539 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
530 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  38.1 
 
 
531 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 
563 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
576 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 
566 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
567 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 
562 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
555 aa  334  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 
569 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
565 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
568 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
565 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
568 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  38.98 
 
 
571 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
568 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
609 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  38.32 
 
 
587 aa  325  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  37.22 
 
 
567 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
567 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  36.82 
 
 
567 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  36.82 
 
 
567 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  36.82 
 
 
567 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
573 aa  317  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
568 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 
556 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
560 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  36.25 
 
 
567 aa  316  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  36.86 
 
 
562 aa  316  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
568 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 
568 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  36.45 
 
 
576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
565 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
565 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  37.88 
 
 
581 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
565 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  36.67 
 
 
574 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 
573 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 
567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  36.26 
 
 
567 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22620  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  39.36 
 
 
594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>