More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1708 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  73.05 
 
 		 594 aa  899    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 593 aa  1233    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  71.67 
 
 		 589 aa  905    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  47.99 
 
 		 559 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  45.6 
 
 		 559 aa  565  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 559 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 552 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  46.54 
 
 		 627 aa  549  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  46.37 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  44.84 
 
 		 559 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 		 557 aa  535  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  45.96 
 
 		 557 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  45.17 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  44.27 
 
 		 582 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  46.56 
 
 		 557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  47.03 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  46.36 
 
 		 534 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  47.23 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  44.48 
 
 		 609 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  44.46 
 
 		 616 aa  511  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 		 546 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  43.29 
 
 		 567 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 552 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  46.34 
 
 		 551 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  43.79 
 
 		 555 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  42.22 
 
 		 571 aa  495  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  42.18 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  42.83 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  42.15 
 
 		 550 aa  458  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  40.84 
 
 		 537 aa  412  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 530 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 576 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  34.28 
 
 		 528 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  34.1 
 
 		 522 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.1 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  34.1 
 
 		 528 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.1 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  34.63 
 
 		 528 aa  352  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 559 aa  351  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.57 
 
 		 528 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 528 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 522 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 		 567 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  35.96 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 528 aa  346  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 530 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 563 aa  343  5.999999999999999e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  36.87 
 
 		 574 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 565 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 565 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 564 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 564 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  36.33 
 
 		 581 aa  336  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 569 aa  335  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  34.82 
 
 		 563 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  35.51 
 
 		 571 aa  334  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  33.69 
 
 		 531 aa  332  8e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 565 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 565 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 560 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 565 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  34.67 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  34.67 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  34.67 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 566 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2842  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 567 aa  326  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  34.72 
 
 		 562 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  34.62 
 
 		 567 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 568 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 563 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 609 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 568 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  36.17 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.09 
 
 		 587 aa  320  6e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 568 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  33.8 
 
 		 567 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 568 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 568 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 562 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 573 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 577 aa  309  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0669  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>