More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  76.74 
 
 		 557 aa  910    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  53.73 
 
 		 559 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  100 
 
 		 582 aa  1209    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  53.85 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  54.61 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  52.06 
 
 		 559 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  51.08 
 
 		 559 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  52.06 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  50.9 
 
 		 559 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  51.26 
 
 		 559 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  53.07 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  50.18 
 
 		 557 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  46.99 
 
 		 550 aa  522  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  44.27 
 
 		 593 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  48.74 
 
 		 616 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 		 551 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  47.03 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  44.74 
 
 		 589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  47.89 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  47.19 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 		 566 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  47.33 
 
 		 546 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  48.19 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  45.05 
 
 		 552 aa  491  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  44.22 
 
 		 571 aa  490  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 		 567 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 		 609 aa  488  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.09 
 
 		 594 aa  487  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  44.95 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  44.71 
 
 		 586 aa  473  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  41.02 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  42.41 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 528 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 559 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 555 aa  346  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  36.8 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 567 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 530 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 564 aa  340  2.9999999999999998e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 565 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 565 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  37.83 
 
 		 528 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  37.83 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 562 aa  337  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 576 aa  336  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  37.64 
 
 		 522 aa  336  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  37.64 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 609 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 528 aa  334  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 566 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  36.03 
 
 		 567 aa  332  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 539 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 539 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.84 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 568 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  37.07 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  37.55 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.15 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  35.71 
 
 		 562 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 569 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 568 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  35.45 
 
 		 567 aa  323  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 567 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  34.68 
 
 		 574 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 568 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  35.33 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  35.33 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 565 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  35.33 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 560 aa  317  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 565 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 565 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 564 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 564 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 567 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 572 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 577 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 568 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  33.82 
 
 		 567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>