More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  100 
 
 		 589 aa  1228    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  71.67 
 
 		 593 aa  905    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  67.75 
 
 		 594 aa  837    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  49.07 
 
 		 559 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  48.73 
 
 		 559 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  48.57 
 
 		 559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  48.21 
 
 		 552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  48.17 
 
 		 559 aa  565  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  48.98 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  48.39 
 
 		 627 aa  561  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 		 559 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  47.29 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  46.11 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  47.24 
 
 		 550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  45.79 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  44.74 
 
 		 582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 		 567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  44.14 
 
 		 609 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  45.85 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  43.95 
 
 		 552 aa  508  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  43.35 
 
 		 555 aa  502  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  45.9 
 
 		 549 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 		 557 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  43.37 
 
 		 563 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  45.07 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 571 aa  487  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  43.29 
 
 		 586 aa  481  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  44.54 
 
 		 546 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  39.97 
 
 		 550 aa  441  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 528 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  35.55 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 555 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 576 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 559 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 530 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 539 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 539 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  36.64 
 
 		 581 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 567 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  36.72 
 
 		 562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 528 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 563 aa  336  7e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  34.17 
 
 		 528 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  34.35 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  34.17 
 
 		 522 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 565 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 565 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 580 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.99 
 
 		 528 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  34.42 
 
 		 567 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.99 
 
 		 528 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  33.99 
 
 		 528 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  34.05 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  34.05 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 568 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 568 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 568 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  34.22 
 
 		 531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 528 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  34.34 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 564 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 564 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 564 aa  324  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 568 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 548 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 556 aa  322  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  34.48 
 
 		 567 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 569 aa  321  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 568 aa  320  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  34.59 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  34.59 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  34.59 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  33.69 
 
 		 563 aa  318  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 573 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  34.32 
 
 		 593 aa  317  6e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 572 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  36.63 
 
 		 576 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 572 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 573 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 609 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  33.39 
 
 		 567 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 568 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2842  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 566 aa  309  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 576 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>