More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1097 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 576 aa  1190    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  57.48 
 
 		 603 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  63.76 
 
 		 571 aa  745    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  86.8 
 
 		 595 aa  1040    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  45.86 
 
 		 576 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  44.94 
 
 		 539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 		 539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  43.81 
 
 		 541 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  44.05 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  44.05 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  43.35 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  43.35 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  43.17 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  43.17 
 
 		 555 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  43.35 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  43.35 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 		 539 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  43.35 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  44.25 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 		 547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 		 544 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  43.92 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  42.12 
 
 		 556 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  41.24 
 
 		 551 aa  435  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  44.68 
 
 		 532 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 535 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  40.79 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  42.09 
 
 		 539 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 552 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 552 aa  359  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 562 aa  342  8e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 541 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 525 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 530 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 560 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 555 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 555 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 555 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 526 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 554 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 555 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  34.62 
 
 		 556 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 537 aa  302  9e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 528 aa  300  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 555 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 563 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 616 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 562 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 551 aa  293  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.41 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.22 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 522 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 561 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  34.03 
 
 		 522 aa  287  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  34.03 
 
 		 528 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 548 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 549 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 567 aa  283  9e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 548 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  30.23 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  31.31 
 
 		 563 aa  280  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 547 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 566 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 571 aa  273  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 557 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  33.15 
 
 		 555 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  33.03 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  32.97 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>