More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0860 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 541 aa  1072    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  43.58 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  44.63 
 
 		 538 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  42.09 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 		 532 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  43.42 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  41.94 
 
 		 539 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 539 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 539 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 539 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  41.94 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  39.16 
 
 		 535 aa  345  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  39.78 
 
 		 556 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 557 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  41.18 
 
 		 539 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 562 aa  339  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  39.82 
 
 		 541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 541 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 		 539 aa  336  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 535 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 555 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 		 562 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 555 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 595 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  36.45 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 571 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 522 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  39.65 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 603 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 		 558 aa  299  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 537 aa  289  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 552 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 560 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 552 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  37.88 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  32.89 
 
 		 572 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  35.29 
 
 		 585 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  34.39 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  34.39 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 609 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 530 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 616 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 554 aa  253  7e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.38 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 568 aa  253  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 568 aa  253  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  33.76 
 
 		 587 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  30.26 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 554 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 552 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 555 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 571 aa  247  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 548 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 548 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 551 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 555 aa  243  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  32.68 
 
 		 607 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.87 
 
 		 528 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.6 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 528 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 592 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>