More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3285 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
513 aa  1033    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  51.81 
 
 
576 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  51.7 
 
 
539 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  51.33 
 
 
541 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  51.53 
 
 
539 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  51.91 
 
 
539 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  51.13 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  52.19 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  51.72 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  51.13 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  49.72 
 
 
562 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  49.81 
 
 
555 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  49.81 
 
 
541 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  49.81 
 
 
541 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  49.81 
 
 
541 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  49.81 
 
 
555 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  49.81 
 
 
541 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  49.81 
 
 
541 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  50.48 
 
 
532 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  48.59 
 
 
553 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  49.24 
 
 
544 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  48.41 
 
 
556 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  49.81 
 
 
538 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  46.7 
 
 
551 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  48.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 
547 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  49.34 
 
 
557 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 
535 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  47.64 
 
 
535 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  52 
 
 
539 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 
543 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  46.68 
 
 
543 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  51.62 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  51.24 
 
 
562 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  45.58 
 
 
526 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 
571 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 
576 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 
595 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 
558 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 
603 aa  362  8e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
562 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
552 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
552 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
522 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
557 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
560 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 
548 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
530 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
530 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  33.77 
 
 
571 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
551 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
547 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
561 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
546 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
553 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
562 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
549 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  33.15 
 
 
572 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  35.69 
 
 
555 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
548 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  31.67 
 
 
568 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  31.67 
 
 
568 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  32.77 
 
 
572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  32.34 
 
 
572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  32.77 
 
 
572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.21 
 
 
571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  32.89 
 
 
572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  32.34 
 
 
572 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
572 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  32.34 
 
 
572 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  32.34 
 
 
572 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
571 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  31.71 
 
 
569 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
553 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
555 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  35.31 
 
 
555 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
609 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 
555 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
554 aa  250  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
555 aa  250  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
555 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
555 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
537 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
616 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
549 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
552 aa  247  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
593 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
563 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  35.4 
 
 
556 aa  246  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  31.23 
 
 
586 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  32.9 
 
 
563 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
567 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 
588 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 
588 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>