More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1316 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  96.29 
 
 		 539 aa  1038    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 555 aa  845    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  92.02 
 
 		 539 aa  1003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  845    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  92.58 
 
 		 539 aa  1002    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  78.97 
 
 		 541 aa  843    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  69.91 
 
 		 556 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  70.28 
 
 		 553 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  78.74 
 
 		 555 aa  842    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  90.17 
 
 		 539 aa  978    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1078    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  71.03 
 
 		 557 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  78.74 
 
 		 541 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  91.84 
 
 		 539 aa  1001    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1078    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  59.03 
 
 		 535 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  58.54 
 
 		 544 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  56.16 
 
 		 576 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  55.12 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  58.44 
 
 		 538 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  55.31 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  51.58 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  52.5 
 
 		 547 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  52.88 
 
 		 543 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 543 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 		 562 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  53.43 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  52.41 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  51.13 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  52.69 
 
 		 562 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  53.07 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  45.5 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 		 595 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  49.53 
 
 		 526 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  44.05 
 
 		 576 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 		 558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 603 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 552 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 		 522 aa  351  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 571 aa  329  8e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 525 aa  326  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 609 aa  316  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  35.1 
 
 		 586 aa  316  7e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  39.28 
 
 		 588 aa  306  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 555 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 548 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  37.07 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  37.07 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  37.59 
 
 		 556 aa  297  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  39.12 
 
 		 555 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 549 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 561 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  38.93 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  38.06 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  35.71 
 
 		 592 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  34.14 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 555 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 547 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 602 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 555 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 549 aa  287  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 557 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  286  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  286  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 555 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  34.19 
 
 		 571 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 563 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  37.92 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 562 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 528 aa  280  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  36.12 
 
 		 584 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>