More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4434 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  64.49 
 
 		 544 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  98.04 
 
 		 562 aa  1090    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  89.74 
 
 		 539 aa  908    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  66.67 
 
 		 538 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 562 aa  1109    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  54.68 
 
 		 551 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  57.71 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  55.78 
 
 		 543 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 		 543 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  52.33 
 
 		 547 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  54.98 
 
 		 541 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  54.73 
 
 		 541 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  54.55 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  53.73 
 
 		 539 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  53.73 
 
 		 539 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  53.36 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 		 556 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 		 553 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  50.47 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  52.24 
 
 		 539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  52.7 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  53.07 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  53.07 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  51.61 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  50.38 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  51.59 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 562 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  51.62 
 
 		 513 aa  475  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 576 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  42.65 
 
 		 595 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  45.77 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.14 
 
 		 558 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  42.27 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 603 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 562 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 552 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 552 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 537 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 609 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 		 525 aa  320  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 548 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 555 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 616 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 567 aa  300  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  300  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  35.12 
 
 		 572 aa  300  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  34.75 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  38.92 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  38.54 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  33.45 
 
 		 571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 560 aa  290  7e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.86 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 554 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  36.56 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  36.56 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  36.61 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 598 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 546 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 593 aa  276  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 530 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  35.5 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  33.64 
 
 		 563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 561 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 555 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>