More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4898 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  64.49 
 
 		 544 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  98.04 
 
 		 562 aa  1090    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  66.48 
 
 		 538 aa  663    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 562 aa  1108    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  90.3 
 
 		 539 aa  914    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  54.87 
 
 		 551 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  57.71 
 
 		 532 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  56.16 
 
 		 543 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  55.6 
 
 		 543 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  52.89 
 
 		 547 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  54.98 
 
 		 541 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  55.1 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  55.1 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  55.1 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  55.1 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  54.92 
 
 		 541 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  55.1 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  54.73 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  53.35 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  52.33 
 
 		 553 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  53.9 
 
 		 539 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  53.43 
 
 		 539 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  51.96 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 539 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  52.69 
 
 		 539 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  52.69 
 
 		 539 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  52.13 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  50.66 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  50.84 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  51.42 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  51.59 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  51.24 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 		 595 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  45.89 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 603 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 		 541 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 562 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 552 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 552 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 		 525 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 609 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  39.67 
 
 		 548 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 616 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 555 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  299  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 567 aa  299  9e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  39.31 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 551 aa  296  8e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 572 aa  296  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 571 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  34.28 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  34.28 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  38.93 
 
 		 555 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 571 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  34.2 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 554 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  36.86 
 
 		 549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.86 
 
 		 586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 557 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 555 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 555 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 555 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 593 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 		 555 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 563 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 561 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  36.55 
 
 		 588 aa  276  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 584 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 549 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  35.43 
 
 		 598 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  36.41 
 
 		 588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 555 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 539 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>