More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1850 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  70.85 
 
 		 539 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  70.3 
 
 		 539 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  71.14 
 
 		 541 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  70.49 
 
 		 555 aa  763    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  71.14 
 
 		 541 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  71.14 
 
 		 541 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  74.21 
 
 		 553 aa  807    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  70.85 
 
 		 539 aa  760    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  71.22 
 
 		 539 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  70.59 
 
 		 541 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  74.02 
 
 		 556 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  71.14 
 
 		 541 aa  762    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 557 aa  1137    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  70.96 
 
 		 541 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  71.03 
 
 		 539 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  70.67 
 
 		 555 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  70.85 
 
 		 539 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  71.03 
 
 		 539 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  54.61 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  56.19 
 
 		 538 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  56.34 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  56.46 
 
 		 535 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  54.81 
 
 		 576 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  53.69 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  50.09 
 
 		 551 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  51.66 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  51.66 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  52.51 
 
 		 562 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  49.26 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  53.32 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 		 562 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  53.35 
 
 		 562 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  51.48 
 
 		 539 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  49.34 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 576 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  49.15 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  43.11 
 
 		 571 aa  445  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  42.91 
 
 		 603 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  42.93 
 
 		 558 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 552 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 541 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 537 aa  336  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 552 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 552 aa  323  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 571 aa  319  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 		 560 aa  317  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 555 aa  316  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 525 aa  316  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 555 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 566 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  35.45 
 
 		 586 aa  306  6e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 616 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 567 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 554 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  38.43 
 
 		 555 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 		 553 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  38.43 
 
 		 555 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 		 555 aa  296  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 555 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  36.13 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 548 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 530 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  36.54 
 
 		 556 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  35.19 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  35.19 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 548 aa  287  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  34.14 
 
 		 571 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 557 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 555 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  34.81 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  35.37 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  34.2 
 
 		 571 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 568 aa  283  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 568 aa  283  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  33.72 
 
 		 531 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  35.96 
 
 		 588 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  35.96 
 
 		 588 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 562 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 585 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  31.7 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>