More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2198 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  59.33 
 
 		 539 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  65.75 
 
 		 546 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  60.37 
 
 		 539 aa  671    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  82.54 
 
 		 548 aa  932    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  65.93 
 
 		 546 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  70.72 
 
 		 546 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 553 aa  1131    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  65.31 
 
 		 545 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  59.19 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  58.6 
 
 		 538 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  58.6 
 
 		 538 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  57.46 
 
 		 567 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  57.14 
 
 		 547 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  61.18 
 
 		 539 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  55.94 
 
 		 543 aa  601  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  56.24 
 
 		 546 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  55.82 
 
 		 542 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  52.56 
 
 		 542 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  55.29 
 
 		 546 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  52.95 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  54.04 
 
 		 541 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  51.33 
 
 		 557 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  54.04 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  54.04 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  54.24 
 
 		 541 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  53.04 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  51.01 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  53.04 
 
 		 539 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  51.38 
 
 		 551 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  51.01 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  41.56 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  37.12 
 
 		 528 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  35.47 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  34.22 
 
 		 525 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  37.43 
 
 		 521 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  35.81 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  33.98 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 549 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 530 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  36.52 
 
 		 549 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  32.38 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  35.84 
 
 		 517 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  36.07 
 
 		 526 aa  278  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 537 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  36.92 
 
 		 515 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.48 
 
 		 528 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  35.64 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 530 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  35.76 
 
 		 519 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  35.82 
 
 		 518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  35.8 
 
 		 503 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  35.94 
 
 		 550 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  32.61 
 
 		 528 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  32.8 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  32.6 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  32.6 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 522 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  35.1 
 
 		 531 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  32.4 
 
 		 528 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  35.67 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  32.4 
 
 		 528 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  33.87 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  32.2 
 
 		 528 aa  257  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 528 aa  256  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  30.31 
 
 		 568 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  30.31 
 
 		 568 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  33.77 
 
 		 513 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  30.13 
 
 		 531 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  34.21 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  33.08 
 
 		 535 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  33.78 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  32.46 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 552 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 552 aa  243  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  33.2 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 552 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  33.01 
 
 		 535 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 549 aa  238  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  34.22 
 
 		 524 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  29.48 
 
 		 571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  32.95 
 
 		 554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  29.7 
 
 		 586 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 537 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 555 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  32.59 
 
 		 530 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  29.33 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  33.2 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  29.55 
 
 		 572 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  32.22 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 544 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  29.55 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  29.55 
 
 		 572 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>