More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0669 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  100 
 
 
503 aa  1024    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  58.94 
 
 
517 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  58.66 
 
 
518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  57.23 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  51.08 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  52.36 
 
 
521 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  52.07 
 
 
528 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  50.2 
 
 
521 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  50.49 
 
 
520 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  49.8 
 
 
549 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  50.39 
 
 
553 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  51.18 
 
 
528 aa  465  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  51.01 
 
 
532 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  49.12 
 
 
527 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  46.93 
 
 
523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  49.8 
 
 
531 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  49.4 
 
 
524 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  49.12 
 
 
526 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  48.14 
 
 
524 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  49.2 
 
 
532 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  47.07 
 
 
519 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  47.79 
 
 
515 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  47.95 
 
 
524 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  49.2 
 
 
530 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  45.96 
 
 
519 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  48.8 
 
 
530 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  46.91 
 
 
518 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  48.24 
 
 
531 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  47.74 
 
 
533 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  43.97 
 
 
525 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  46.53 
 
 
550 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  43.03 
 
 
527 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  42.26 
 
 
513 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  40.69 
 
 
501 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 
537 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  39.09 
 
 
503 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  37.5 
 
 
541 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  38.4 
 
 
554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  38.22 
 
 
505 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  36.96 
 
 
535 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
546 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 
543 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
548 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
514 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
557 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  32.87 
 
 
567 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
553 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
539 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  33.92 
 
 
539 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  34.36 
 
 
517 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  34.5 
 
 
517 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  34.84 
 
 
522 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  32.08 
 
 
542 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
546 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 
545 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 
547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
546 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
539 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 
546 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
537 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
538 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
538 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
546 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
490 aa  223  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  31.09 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
542 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.76 
 
 
514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
512 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
542 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
538 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  33.89 
 
 
541 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.37 
 
 
500 aa  213  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  39.2 
 
 
541 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
521 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  39.2 
 
 
541 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 
539 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  39.2 
 
 
541 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
530 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.51 
 
 
510 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  209  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
551 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 
506 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
548 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
499 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
510 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 
510 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 
510 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
551 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>